我国养老保险体系主要包括基本养老保险、补充养老保险和个人储蓄性养老保险三个层次，其中，补充养老保险包括企业年金和职业年金。企业年金主要针对企业，是指根据《企业年金办法》等国家相关政策规定，企业及其职工在依法参加基本养老保险的基础上，自愿建立的补充养老保险制度。职业年金主要针对事业单位，是指根据《机关事业单位职业年金办法》（国办发〔2015〕18号文件发布）等国家相关政策规定，事业单位及其职工在依法参加基本养老保险的基础上，建立的补充养老保险制度。
1.补充养老保险个人所得税处理
根据《财政部国家税务总局关于个人所得税有关问题的批复》（财税〔2005〕94号）的规定，单位为职工个人购买商业性补充养老保险等，在办理投保手续时应作为个人所得税的“工资、薪金所得”项目，按税法规定缴纳个人所得税；因各种原因退保，个人未取得实际收入的，已缴纳的个人所得税应予以退回。
2.年金递延纳税政策
年金递延纳税，是指在年金缴费环节和年金基金投资收益环节暂不征收个人所得税，将纳税义务递延到个人实际领取年金的环节，也称EET模式（E代表免税，T代表征税）。EET模式是西方发达国家对企业年金普遍采用的一种税收优惠模式。据了解，OECD国家中，法国、德国、美国、日本等多数国家均选择了EET模式。2013年底，为促进我国多层次养老保险体系的发展，在研究借鉴发达国家通行做法的基础上，结合我国实际，国家对年金个人所得税政策体系进行了完善，《财政部国家税务总局人力资源和社会保障部关于企业年金职业年金个人所得税有关问题的通知》（财税〔2013〕103号）出台了如下企业年金、职业年金个人所得税递延纳税政策。
（1）年金缴费的个人所得税处理。
①企业和事业单位（以下统称单位）根据国家有关政策规定的办法和标准，为在本单位任职或者受雇的全体职工缴付的企业年金或职业年金（以下统称年金）单位缴费部分，在计入个人账户时，个人暂不缴纳个人所得税。
②个人根据国家有关政策规定缴付的年金个人缴费部分，在不超过本人缴费工资计税基数的4%标准内的部分，暂从个人当期的应纳税所得额中扣除。
③超过上述第①项和第②项规定的标准缴付的年金单位缴费和个人缴费部分，应并入个人当期的工资、薪金所得，依法计征个人所得税。税款由建立年金的单位代扣代缴，并向主管税务机关申报解缴。
④企业年金个人缴费工资计税基数为本人上一年度月平均工资。月平均工资按国家统计局规定列入工资总额统计的项目计算。月平均工资超过职工工作地所在设区城市上一年度职工月平均工资300%以上的部分，不计入个人缴费工资计税基数。
职业年金个人缴费工资计税基数为职工岗位工资和薪级工资之和。职工岗位工资和薪级工资之和超过职工工作地所在设区城市上一年度职工月平均工资300%以上的部分，不计入个人缴费工资计税基数。
即在年金缴费环节，对单位根据国家有关政策规定为职工缴付的企业年金或职业年金单位缴费部分，在计入个人账户时，个人暂不缴纳个人所得税；个人根据国家有关政策规定缴付的年金个人缴费部分，在不超过本人缴费工资计税基数的4%标准内的部分，暂从个人当期的应纳税所得额中扣除。
（2）年金基金投资运营收益的个人所得税处理。
年金基金投资运营收益分配计入个人账户时，个人暂不缴纳个人所得税。即在年金基金投资环节，企业年金或职业年金基金投资运营收益分配计入个人账户时，暂不征收个人所得税。
（3）领取年金的个人所得税处理。
①个人达到国家规定的退休年龄，在2014年1月1日之后（至2018年12月31日）按月领取的年金，全额按照“工资、薪金所得”项目适用的税率，计征个人所得税；在2014年1月1日之后按年或按季领取的年金，平均分摊计入各月，每月领取额全额按照“工资、薪金所得”项目适用的税率，计征个人所得税。
②对单位和个人在2014年1月1日财税〔2013〕103号文件实施之前开始缴付年金缴费，个人在该文件实施之后领取年金的，允许其从领取的年金中减除在该文件实施之前缴付的年金单位缴费和个人缴费且已经缴纳个人所得税的部分，就其余额按照财税〔2013〕103号文件第三条第1项的前段所述（1）的规定征税。在个人分期领取年金的情况下，可按该文件实施之前缴付的年金缴费金额占全部缴费金额的百分比减计当期的应纳税所得额，减计后的余额，按照前段所述的该文件第三条第1项规定，计算缴纳个人所得税。
③2018年12月31日前，对个人因出境定居而一次性领取的年金个人账户资金，或个人死亡后，其指定的受益人或法定继承人一次性领取的年金个人账户余额，允许领取人将一次性领取的年金个人账户资金或余额按12个月分摊到各月，就其每月分摊额，按照该文件第三条第1项和第2项的规定计算缴纳个人所得税。对个人除上述特殊原因外一次性领取年金个人账户资金或余额的，则不允许采取分摊的方法，而是就其一次性领取的总额，单独作为一个月的工资、薪金所得，按照该文件第三条第1项和第2项的规定，计算缴纳个人所得税。
综上所述，在年金领取环节，个人达到国家规定的退休年龄领取的企业年金或职业年金，按照“工资、薪金所得”项目适用的税率，计征个人所得税。
④个人领取年金时，其应纳税款由受托人代表委托人委托托管人代扣代缴。年金账户管理人应及时向托管人提供个人年金缴费及对应的个人所得税纳税明细。托管人根据受托人指令及账户管理人提供的资料，按照规定计算扣缴个人当期领取年金待遇的应纳税款，并向托管人所在地主管税务机关申报解缴。
⑤建立年金计划的单位、年金托管人，应按照个人所得税法和税收征收管理法的有关规定，实行全员全额扣缴明细申报。受托人有责任协调相关管理人依法向税务机关办理扣缴申报、提供相关资料。
（4）新税制实施后的处理。
自2019年1月1日起，根据《财政部税务总局关于个人所得税法修改后有关优惠政策衔接问题的通知》（财税〔2018〕164号）第四条的规定，个人达到国家规定的退休年龄，领取的企业年金、职业年金，符合《财政部人力资源社会保障部国家税务总局关于企业年金职业年金个人所得税有关问题的通知》（财税〔2013〕103号）规定的，不并入综合所得，全额单独计算应纳税款。其中按月领取的，适用月度税率表计算纳税；按季领取的，平均分摊计入各月，按每月领取额适用月度税率表计算纳税；按年领取的，适用综合所得税率表计算纳税。
个人因出境定居而一次性领取的年金个人账户资金，或个人死亡后，其指定的受益人或法定继承人一次性领取的年金个人账户余额，适用综合所得税率表计算纳税。对个人除上述特殊原因外一次性领取年金个人账户资金或余额的，适用月度税率表计算纳税。
（5）操作与申报。
就年金所得来看，企业年金、职业年金涉及纳税义务主要集中在缴费和领取两个环节。在年金缴费环节，由个人所在单位在其缴费时，对超出免税标准的部分随同当月工资、薪金所得一并计算代扣个人所得税，并向其所在单位主管税务机关申报缴纳；在年金领取环节，由托管人在为个人支付年金待遇时，根据个人当月取得的年金所得、往期缴费及纳税情况计算扣缴个人所得税，并向托管人主管税务机关申报缴纳。
①单位建立年金计划后，应在建立年金计划的次月15日内，向其所在地主管税务机关报送年金方案、人力资源社会保障部门出具的方案备案函、计划确认函以及主管税务机关要求报送的其他相关资料。年金方案、受托人、托管人发生变化的，应在发生变化的次月15日内重新向其主管税务机关报送上述资料，供税务部门登记备案。
②缴费环节，由个人所在单位为其计算扣缴个人所得税，并向主管税务机关申报解缴。
③领取环节，应纳税款由受托人代表委托人委托托管人代扣代缴。年金账户管理人应及时向托管人提供个人年金缴费及对应的个人所得税纳税明细。托管人根据受托人指令及账户管理人提供的资料，按照规定计算扣缴个人当期领取年金待遇的应纳税款，并向主管税务机关申报解缴。
单位和托管人在扣缴个人所得税时，必须按照税法规定实行全员全额扣缴明细申报。建立年金计划的单位、委托人、受托人、账户管理人之间要及时传递纳税相关的信息。受托人负责统筹协调并督促有关机构依法向税务部门办理扣缴申报及提供涉税资料。
综上所述，年金计缴个人所得税可按如下四个步骤进行：
第一步：计算年金个人缴费工资计税基数。
企业先计算各员工的上一年度月平均工资。事业单位先计算各职工的岗位工资和薪级工资之和。
企业人员月平均工资需按国家统计局规定列入工资总额统计的项目计算，相对复杂些。根据《关于工资总额组成的规定》（国家统计局令〔1990〕第1号），工资总额的计算应以直接支付给职工的全部劳动报酬为根据，由计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资、特殊情况下支付的工资共六个部分组成，但出差伙食补助费、误餐补助、调动工作的旅费和安家费、计划生育独生子女补贴等11项不列入工资总额的范围。
企业员工上一年度月平均工资（或事业单位职工岗位工资和薪级工资之和）如果不超过工作地所在设区城市上一年度职工月平均工资300%，即为年金个人缴费工资计税基数；如果超过了，则超过300%以上的部分，不计入个人缴费工资计税基数。
第二步：比较年金个人缴费部分与本人缴费工资计税基数的4%。
如果年金个人缴费部分不超过本人缴费工资计税基数的4%，则不计缴个人所得税；超过4%的部分，并入当期工资、薪金所得，计缴个人所得税。
第三步：比较年金单位缴费部分与国家政策规定的标准。
如果企（事）业单位缴费部分不超过国家政策规定的标准，在计入个人账户时，个人不计缴个人所得税；超过标准的部分，并入当期工资、薪金所得，计缴个人所得税。
根据《企业年金办法》第八条的规定，企业缴费每年不超过本企业上年度职工工资总额的1/12。企业和职工个人缴费合计一般不超过本企业上年度职工工资总额的1/6。
根据《机关事业单位职业年金办法》第八条的规定，单位缴纳职业年金费用的比例最高不超过本单位上年度缴费工资基数的8%。个人缴费比例不超过上年度本人缴费工资基数的4%。
第四步：将工资、薪金所得与第二步、第三步计算出的并入部分合计，按工资、薪金所得纳税。