华亭县的历史可以追溯到隋朝时期，当时设立了华亭县，其名称源于白马、华和亭三川口。据《太平寰宇记》记载，因皇甫麓的华尖山亭而得名的华亭镇则在北魏普泰二年建立。隋大业元年（公元605年），华亭县正式成立，成为中国历史的一部分。中华人民共和国成立后，华亭县依然存在，直到1958年12月，它与平凉市合并。然而，1962年，华亭县又重新恢复了独立，并一直延续至今。
华亭县的行政区域划分为5个镇、5个乡、1个街道办事处和1个省级工业园区，涵盖了101个行政村和27个社区。在2000年人口普查中，全县总人口为168,944人，包括东华镇40,453人，安口镇26,450人，上关乡10,513人，神峪回族乡11,494人等，各个乡镇人口分布各有特点。
2003年，甘肃省民政厅进行了一次乡镇行政区划调整，根据甘民区复字[2003]49号文件和平政发[2003]180号文件，南川乡被并入安口镇，麻庵乡则并入了西华镇，这一调整反映了行政区划的变迁，也反映了华亭县在现代化进程中的一些管理变动。
华亭县地名，上海市与甘肃省各有一个叫华亭县的地方。