中国地质科学院，现归国土部直属事业单位中国地质调查局统一管理，他下面有两个研究单位以水文地质为优势，中国地质科学院水文地质环境地质研究所，是全国唯一水工环的公益性事业单位，其中水就是水文地质；中国地质科学院岩溶地质研究所，唯一的岩溶研究所，岩溶水文地质是其专长，联合国教科文组织世界岩溶中心也在该单位。另外，国土资源部直属事业单位中国地质调查局的水文地质环境地质调查中心，国内专业的水文地质调查研究中心，这里面很多教授也在中国地质大学，石家庄经济学院等不同高校等招收水文地质专业研究生。
中国科学院地理所等一些科研机构也有相关专业。
高校方面：
中国地质大学（原北京地院）、长安大学（原西安地院）、成都理工大学（原成都地院）、石家庄经济学院（原河北地院）这几个都是曾经的国内大地院
另外，好多其它的一些综合类院校清华、北大等很多都有相似专业。
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