【概念】
文件系统是操作系统用于明确磁盘或分区上的文件的方法和数据结构；即在磁盘上组织文件的方法。也指用于存储文件的磁盘或分区，或文件系统种类。
操作系统中负责管理和存储文件信息的软件机构称为文件管理系统，简称文件系统。
文件系统由三部分组成：与文件管理有关软件、被管理文件以及实施文件管理所需数据结构。从系统角度来看，文件系统是对文件存储器空间进行组织和分配，负责文件存储并对存入的文件进行保护和检索的系统。
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【区别】
目前的文件系统一般分为FAT、NTFS、HFS（由苹果电脑开发，并使用在Mac OS上的文件系统）、Ext2、Ext3、Ext4（这3个是Linux 系统中标准的文件系统）.
是不同公司开发的不同文件系统，各有优缺点
如果感兴趣，可以看这里，有详细介绍
http://baike.baidu.com/view/266589.htm