蛋白质序列指纹图谱基于多序列比对的结果,它由比对结果得到一系列相当保守的序列模体构建而成,用来表示蛋白质家族特征。蛋白指纹图谱技术是由蛋白质芯片及分析仪器—表面加强激光解析电离飞行时间质谱两部分组成,可以将病人血清中蛋白质成分的变化记录下来,绘制成蛋白指纹质谱图,并显示样品中各种蛋白的分子量、含量等信息。通过这项技术,将来人们有可能拥有自己的生命光盘,记录下个人有生以来不同阶段的蛋白指纹图谱,从分子水平了解并观察自己的生理变化,或作为治疗前后的比对参照。蛋白指纹图谱和蛋白质芯片是继基因芯片技术之后新一代生物芯片技术,蛋白指纹图谱技术(本技术在国内已获得蛋白指纹法专利:用于生物样品分析的蛋白指纹法,专利号ZL 03148375.5, 发明人: 许洋)被国际顶级科学杂志《科学》以及医学界权威杂志《柳叶刀》评为世界蛋白指纹图谱和蛋白质芯片排名第一的技术。其专利蛋白指纹图谱技术最大优点是快速、简便、易行、样品用量小和高通量分析等特点。它可直接检测尿液、血液、脑脊液、关节腔滑液、支气管洗脱液、细胞裂解液和各种分泌物等,在应用方面具有绝对优势。在美国通过应用蛋白指纹图谱专利技术以使一些州立、市立大学的科学家走在科技最前沿,成为世界科技的领导者。