法律分析：船员健康证要到省出入境检验检疫局办理，经过体检合格后，将颁发健康证。船员健康证的办理流程具体如下：
1、到办理窗口领取体检申请表。同时要填写表格。
2、填表后，提交身份证原件及复印件，近期免冠照片4张，缴纳费用。
3、按照程序完成各项体检项目。
4、如体检合格，领取回执单，在约定的时间内领取健康证。船员健康证的全称叫海船船员健康证书，健康证是每一个人出国必须要办理的健康证明，证明在出国前没有任何传染性或者危害公共安全的病症。
法律依据：《中华人民共和国船员条例》 第四十条 海事管理机构应当建立健全船员管理的监督检查制度，重点加强对船员注册、任职资格、履行职责、安全记录，船员培训机构培训质量，船员服务机构诚实守信以及船员用人单位保护船员合法权益等情况的监督检查，督促船员用人单位、船舶所有人以及相关的机构建立健全船员在船舶上的人身安全、卫生、健康和劳动安全保障制度，落实相应的保障措施。