1、利息不同：余额宝是一种资金管理服务。转入余额宝，即购买货币基金，可享货币基金收益； 货币基金销售服务将由蚂蚁金服网商银行提供支持，由网商银行与多家金融机构合作，提供更多理财选择。
货币基金主要用于投资国债、银行存款等有价证券。投资者购买货币市场基金并不等于将资金作为存款存放在银行或者存款类金融机构，基金公司不保证基金一定盈利，也不保证最低收益。
2、两者本质（或者说是使命）不同：余额宝是一种货币基金，它是支付宝旗下的一个理财产品，它本身是没有网络支付功能的，它只是绑定了支付宝并通过支付宝的支付流程完成支付，实际上还是由支付宝走完网络支付流程的，本质上它不像支付宝一样具有第三方支付功能。
3、两者获得收益是不同的：支付宝余额它就像银行卡储存存支付宝当中的资金，它不会增多也不会减少。但是余额宝理论上是有盈亏的，实际上余额宝都是有收益的，收益虽然比较少，但是它可以使得你的余额增多。
4、两者授权额度不同：由于政策的原因，这两年支付宝余额提现和支付都是有额度限制的，但是通过从支付宝余额转到余额宝以后，余额宝本身只是一个余额增值服务，没受政策影响，没有这个额度限制。
扩展资料：
余额宝优点
1、是兼具收益性和流动性。
与传统理财产品相比，余额宝类产品“比存款更高息，比基金更方便”为用户提供了一项在收益性与流动性上均有不错表现的新兴理财工具。相比活期存款0.35%的利率，余额宝类产品动辄5%以上的收益区间显然具有极强的吸引力，甚至比定期存款收益还高出一截。
一般的货币基金赎回需要2个交易日左右到账，而余额宝类产品支持T+0实时赎回，意味着转入支付宝[微博]中的资金可以随时转出至支付宝余额进行消费，实时到账无手续费，也可直接提现至银行卡，流动性堪比“准货币”。
2、是操作流程简单，使用方便快捷。
余额宝类产品将基金公司的基金直销系统内置于支付宝网站，用户可以在支付宝中进行基金的购买或者赎回，整个流程和支付宝充值、提现或购物一样简单。在2013年7月1日以后，客户可以通过手机进行操作余额宝账户，随时买入、卖出、查看收益，异常方便快捷。
3、是投资门槛低，吸引全民参与。
余额宝类产品不限制用户的最低购买金额，一方面有利于能够最大限度的集中社会所有零碎、闲散资金，提升社会资本的利用率，同时让客户享受最便捷的理财服务，另一方面也对较多从未涉及理财业务的客户进行了投资理财观念的启蒙，尤其以后者对整个社会树立正确的敏锐的投资理财观念起到了重要的作用。
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