温州市区的医院包括：
1. 温州市人民医院
2. 温州市中心医院
3. 温州市中医院
4. 温州医科大学附属第一医院
5. 温州医科大学附属第二医院
详细解释：
温州市人民医院是温州市区内一所集医疗、预防、科研、教学于一体的综合性医院。该医院拥有先进的医疗设备和技术，提供各类疾病的诊疗服务。
温州市中心医院作为另一所重要的医疗机构，致力于为广大市民提供高质量的医疗服务。该医院设有多个特色科室，涵盖了内科、外科、妇科等多个领域。
温州市中医院则是以中医药服务为特色的医疗机构，除了常规的西医诊疗，还注重中医药的治疗手段，为市民提供多元化的医疗选择。
此外，温州医科大学的两所附属医院——温州医科大学附属第一医院和温州医科大学附属第二医院，作为教学医院，不仅拥有高超的医疗技术，还承担着培养医学人才的任务。这两所医院在科研方面也有较高的成就，经常开展各类医学研究和临床试验。
以上这些医院都是温州市区内的主要医疗机构，为市民提供全面的医疗服务。