专门处理海事和海商法律事务的机构是海事法院，它负责审理第一审的海事案件和海商案件。这类法院的司法权限仅限于此类专业领域，不涉及刑事案件和一般的民事诉讼。对于海事法院的判决或裁定，如有上诉，将由案件所在地的高级人民法院来处理。
海事法院内部组织结构包括海事审判庭、海商审判庭以及研究室和办公机构，这些部门共同协作，确保案件的专业处理。海事法院的领导层由院长、副院长、庭长、副庭长和审判员组成，他们各自承担着重要的职责。院长的任命由所在地的人大常委会主任提名，并经本级人大常委会审议通过。副院长、庭长、副庭长、审判员以及审判委员会委员的任免也同样遵循这一程序，由海事法院院长提请并经人大常委会决定。
专门人民法院是我国统一审判体系——人民法院体系中的一个组成部分，它和地方各级人民法院共同行使国家的审判权。