入境超过5000美元处理方法如下：
1、入境人员携带外币现钞入境，超过等值5000美元的应当向海关书面申报，如实申报的，海关会予以放行。如果未如实申报或未申报的话，会构成违规，将面临外币数额20%的罚款。
2、当天多次往返及短期内多次往返者（指15天内出境或入境超过一次）不适用上述规定，且携带外币现钞入境不论金额大小都需向海关书面申报。
3、出境携带外币现钞限额为每人等值5000美元，超过等值5000美元以上的，应向外汇指定银行或外汇管理部门申领《携带外汇出境许可证》（以下简称《携带证》），海关凭加盖外汇指定银行印章的《携带证》验放。
4、出入境人员携带人民币现钞的限额为2万元。超过该限额的，一律不予放行。
入境的申请流程如下：
1、近期免冠照片一张以及填写完整的《中华人民共和国出入境通行证申请表》 。
2、居民身份证和户口簿及复印件。在居民身份证领取、换领、补领期间，可以提交临时居民身份证和户口簿及复印件。
3、未满十六周岁的，还应当由其监护人陪同，提交其监护人出具的同意出境的意见、监护人的居民身份证或者户口簿、护照及复印件。
4、家工作人员还应当按照有关规定，提交本人所属工作单位或者上级主管单位按照人事管理权限审批后出具的同意出境的证明。
5、当地公安机关出入境管理部门规定的其他材料。
综上所述，个人携带入境或出境的外币、人民币现金数额均应当在规定的限额内，一般为等值5万元人民币。同时，个人也应该如实申报携带的现金数额，否则可能导致被海关查处并处罚款。
【法律依据】：
《中华人民共和国海关行政处罚实施条例》
第十四条
违反国家进出口管理规定，进出口国家限制进出口的货物，进出口货物的收发货人向海关申报时不能提交许可证件的，进出口货物不予放行，处货物价值30%以下罚款。
违反国家进出口管理规定，进出口属于自动进出口许可管理的货物，进出口货物的收发货人向海关申报时不能提交自动许可证明的，进出口货物不予放行。第十五条 进出口货物的品名、税则号列、数量、规格、价格、贸易方式、原产地、启运地、运抵地、最终目的地或者其他应当申报的项目未申报或者申报不实的，分别依照下列规定予以处罚，有违法所得的，没收违法所得：
（一）影响海关统计准确性的，予以警告或者处1000元以上1万元以下罚款。
（二）影响海关监管秩序的，予以警告或者处1000元以上3万元以下罚款。
（三）影响国家许可证件管理的，处货物价值5%以上30%以下罚款。
（四）影响国家税款征收的，处漏缴税款30%以上2倍以下罚款。
（五）影响国家外汇、出口退税管理的，处申报价格10%以上50%以下罚款。
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