原理是，蛋白质分子是带电分子，在固定电场下，带电体会发生运动。想象一下，在受到同等动力和阻力情况下，是不是越重的分子移动速度越慢啊，这样在固定时间内就可以把相对分子质量不同的蛋白质分子分离开来了。严格意义上讲，化学中“分子大小”这个术语是不应该出现的，因为这个称呼是告诉别人分子体积大，还是相对分子质量高呢？所以，用相对分子质量来说更加准确科学。
追问可书上说的是分子小的进入凝胶内啊
追答不是进入凝胶内，是进入凝胶内部的小孔内，无论怎么样其原理都是受力相同阻力相同，分子质量越大，其越到的阻力越大。当然分子相对质量越大，其体积一般也较大，这是因为蛋白质分子是由氨基酸残基构成的，其基础框架仍可认为是C骨架。所以说是分子的相对质量更为科学。