1、技术原理不同
公交手机扫码支付是利用二维码远程访问支付系统，并提交支付指令的支付方式。而常用公交一卡通是一种非接触式的IC卡，与读写器之间通过无线电波完成读写工作。
2、解决充值问题
公交手机扫码支付虚拟电子卡可以直接通过余额、支付宝、银行卡扣款支付车费，不仅免去了携带实体卡的困扰，也解决了公交卡余额不足、定点充值等烦恼。
3、优惠政策不同：
公交卡有一定的乘车优惠，支付宝电子公交卡没有。
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扩展资料：
支付宝充值电子公交卡的步骤：
1、进入到支付宝的城市服务页面之后，大家需要选择上方的电子公交卡功能，从而打开公交卡的详情页面充值。
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2、从电子公交卡详情页面里，大家可以直接点击“卡片充值”选项，然后开启“先乘车后付款”的服务。
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3、在这之后，从页面的底端点击充值按钮，大家就可以为当前电子公交卡一次充值最低30元的现金。
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参考资料来源：/baike.baidu.com/item/%E5%85%AC%E4%BA%A4%E5%8D%A1/8433080?fr=aladdin"target="_blank"title="百度百科-公交卡">百度百科-公交卡
参考资料来源：/sjz.hebnews.cn/2018-03/12/content_6804891.htm"target="_blank"title="河北新闻网-“石家庄电子公交卡”成功上线">河北新闻网-“石家庄电子公交卡”成功上线