计算机应用技术系
计算机应用技术系是计算机学院所包含的四个系之一，计算机应用系是北京工业大学“十五”“211工程”重点建设学科及北京市重点学科，拥有博士点、博士后流动站和“多媒体与智能软件技术”北京市重点实验室。计算机应用技术系下设三个教研室，人工智能与知识工程教研室，模式识别与图像处理教研室，多媒体技术与图形学教研室。
在北京工业大学“211工程”、北京市重点学科、北京市重点实验室建设及包括国家、北京市重点、重大科研项目在内的国家级、北京市级科研项目经费的联合资助下，我系建起了良好的教学科研环境，拥有雄厚的师资队伍。现有院士1名（兼职），博士生指导教师7名（兼职3名），硕士生指导教师17名，讲师8名，助教1名，已经培养了大批的本科生和研究生，毕业生就业前景良好。汤姆逊、松下、IBM、摩托罗拉、朗讯、SAS、路透等国际性大公司和联想、上海广电、华为、 3G研发中心、中星微电子、上海盛大、方正、联通、网通等国内大的研究院或公司都有我们的学生。也有学生到高校、机关事业单位从事相关工作。多年来我系在人工智能与知识工程、模式识别与图像处理、多媒体技术与图形学领域取得了多项成果，已完成和正在主持多项国家自然科学基金、863、973项目，多项成果达到了国内领先、国际先进水平。获得国家科技进步二等奖1项，北京市科技进步奖4项。
在北京工业大学力争融入北京经济建设和社会发展，积极参与全国经济建设，创建国内一流的教学研究型大学的目标鼓舞下，本系力争建成具有先进科研环境，在研究水平、人才培养、对外合作与交流等方面达到国内一流水平，国际上有一定影响和地位的计算机应用技术系。
软件与理论系
计算机软件与理论学科具有先进的计算机设备和良好的实验环境，拥有一批高素质的师资队伍。2003年以来，承担了多项国家863和省部级基金项目，开发了一批应用软件系统和软件产品，有多项研究成果获奖，一部分已产生了效益。软件自动化方法的研究、地理信息系统领域的研究处于国内先进水平，物流系统和数据仓库系统的应用开发在首都经济建设中发挥了显著的作用。每年在国内外核心期刊上发表论文数十篇，在教学方面曾获多项国家级和省部级教学成果奖，为国家培养了大批高素质的软件人才。
信息安全系
信息安全专业是计算机、通信、数学、法律和管理等领域的交叉学科，主要研究确保信息安全的科学和技术。培养能够从事计算机、通信、电子商务、电子政务、电子金融等领域的信息安全专门技术人才。本专业的学生应有扎实的理论基础，又要有较强的应用能力和科学研究能力。
系统结构系
计算机系统结构系是计算机学院三大基础教学部之一，主要承担计算机科学与技术专业基础课程本科教学工作。此外也承担计算机应用、信息安全专业的系统结构和网络等方面的本科生教学与指导工作。现有教师26人，其中具有副教授以上高级技术职称的教师15人。与实验中心一起承担系统结构、计算机组成原理、大型硬件系统、计算机网络等课程设计工作。每年指导100多名本科学生毕业设计和20余名研究生。学科部具有一定的科研和工程实践实力，承担北京市教委、科委以及学校科研项目多项，也同时承接了网络工程方面的项目。
