办公室
协助中心领导负责行政、党务和业务管理的协调；草拟、打印综合性材料；中心人事、经费、财产物业、档案和职工职称、工资、福利、待遇的管理;宣传教育、综合治理、计划生育和对外协调工作。
缴费申报核定科
基本医疗保险、工伤保险、生育保险、大额医疗费统筹的扩覆和大额医疗费的征集工作；建立参保单位、参保职工基础信息电子档案；受理参保单位缴费申报、缴费核定和年度缴费工资变换及相关数据的录入工作；受理参保单位变更、注销登记以及参保单位职工异动等增减变化业务；领取基金回款单、回款对帐，建立基金征收电子台帐。
居民医保科
居民医保费的扩覆和征集工作，建立参保人员的基础信息电子档案，受理参保人员缴费申报、缴费核定相关数据的录入工作。参保职工个人帐户的配置，个人帐户的计息；死亡职工销卡、余款的转移、继承业务；受理IC卡值圈存、个人信息查询。
工伤保险科
工伤保险浮动费率的测算；受理工伤事故申报；参与工伤事故现场勘察；工伤事故预防、工伤救治、康复管理和工伤待遇审核。
基金管理科
编制医疗、工伤、生育等各项保险基金的预决算；保险基金收入、支出明细分类登记；与财政、银行对帐；财政专户向支出户拨款申请及各项保险费用支付；编制月、季、半年、年基金财务报表及报表上报；记帐凭证科目汇总。受理定点医疗机构普通门诊、特殊慢性病门诊、住院（含大额医疗）医疗费用、异地安置人员医疗费用和定点零售药店医疗费用的审核结算及相关数据的录入工作；负责定点医疗机构住院结算标准的测算和年度医疗费用的测算工作。
医疗管理科
负责医疗、工伤、生育三项保险的医疗管理工作，建立定点医疗机构、定点零售药店基础信息电子档案和享受慢性病待遇患者基础电子档案；在取得定点资格的医疗机构、零售药店范围内选定定点医疗机构、零售药店；起草、签订医疗服务协议；对定点医疗机构执行“三个目录”实施监督管理，核减不合理诊疗项目、药品项目等医疗费用；督促定点医疗机构、零售药店执行医疗保险政策；定期不定期的对“两定”进行抽查、考核；参与年度综合考核；受理参保职工医疗投诉、协调医患矛盾；受理转诊、转院审批，易地购药审批。
计算机信息管理科
计算机管理系统硬件维护与升级；网络及终端设备维护；数据维护及软件的统一开发；对相关单位计算机业务人员的培训；医疗、工伤、生育保险各类数据统计、数据分析和表报上报工作。
综合科
生育保险科
