南京的大学有：南京大学、东南大学、南京航空航天大学、南京理工大学、南京工业大学。
1.南京大学是一所历史悠久、声誉卓著的高等学府。其前身是创建于1902年的三江师范学堂，此后历经两江师范学堂、南京高等师范学校、国立东南大学、国立第四中山大学、国立中央大学、国立南京大学等历史时期，于1950年更名为南京大学。
2.东南大学(简称东大)，英文名称为Southeast University(缩写：SEU)，位于江苏省南京市，是中国最早建立的高等学府之一。
学校创建于1902年的三江师范学堂，后历经两江师范学堂、南京高等师范学校、国立东南大学、国立中央大学、南京工学院等办学时期。1988年5月，学校复更名为东南大学。2000年4月，原东南大学、南京铁道医学院、南京交通高等专科学校合并，南京地质学校并入，组建新的东南大学。
3.南京航空航天大学创建于1952年10月，是新中国自己创办的第一批航空高等院校之一。1978年被国务院确定为全国重点大学；1981年经国务院批准成为全国首批具有博士学位授予权的高校；1996年进入国家“211工程”建设；2000年经教育部批准设立研究生院。
2011年，成为“985工程优势学科创新平台”重点建设高校；2017年，进入国家“双一流”建设序列，现有航空宇航科学与技术、力学、控制科学与工程三个学科入选第二轮“一流学科”建设名单。学校现隶属于工业和信息化部。2012年12月、2021年4月，工业和信息化部、中国民航局先后签署协议共建南京航空航天大学。2018年12月，工业和信息化部、教育部、江苏省共建南京航空航天大学。
4.南京理工大学，211大学、世界一流学科建设高校，隶属于工信部，由工信部、教育部与江苏省共建，是中国兵器协同创新联盟成员单位，素有“兵器技术人才摇篮”的美誉。
5.南京工业大学位于江苏省南京市，可以追溯到1902年的三江师范学堂，后经历多个阶段，于1958年创建南京化工学院，2001年更名为南京工业大学，同年，南京建筑工程学院并入，组建了新的南京工业大学。
学校现有28个学院，开设101个本科专业，其中包括31个国家一流本科专业建设点，7个国家级特色专业建设点，化学工程与技术为国家一级重点学科。
南京高校的发展趋势：
1. 产学研结合：南京高校将继续加强与企业和科研机构的合作，推动产学研结合，促进科技成果的转化和应用。
2. 国际化发展：南京高校将加强与国际高水平大学的交流合作，吸引更多国际学生和教师来南京学习和工作，推动南京高校的国际化发展。
3. 人才培养创新：南京高校将注重培养学生的创新能力和实践能力，加强实践教育和科技创新能力的培养，培养更多适应社会需求的人才。
4. 学科交叉融合：南京高校将加强学科间的交叉融合，推动学科之间的协同创新，培养具有综合能力的高级人才。