1、其区别分别是：
护照：是国籍的证明及外国旅行的证件。
港澳通行证：是内地居民专程到香港澳门的通行证件。
2、港澳通行证说明：通俗一点讲：如果把香港澳门作为一个“外国国家”来看的话，港澳通行证就是相当于签证。官方定义：内地居民因私往来香港或澳门特别行政区旅游、探亲、从事商务、培训、就业等非公务活动，向户口所在地的市、县公安出入境管理部门提出申请。凭公安出入境管理部门签发的往来港澳通行证及有效签注前往。
3、护照说明：通俗一点讲：相当于国际上各个国家都认可的“居民身份证”，你有身份证并不代表你能去各个国家，是否有资格去，那就要“签证”了。官方定义：护照是一个国家的公民出入本国国境和到国外旅行或居留时， 由本国发给的一种证明该公民国籍和身份的合法证件。
4、持中国公民有效护照经香港前往其它国家或地区的过境旅客如能符合一般的入境规定，包括持有前往目的地的有效入境证件及供海外旅游并已经确认的续程车/船/机票，可在每次入境时获准在港逗留7天而无需事先领有进入认可。
5、各国颁发的护照种类不尽相同。中国的护照分为外交护照、公务护照和普通护照，普通护照又分因公普通护照和因私普通护照。