中国农业大学的食品科学与工程学院下设四个系和七个研究中心（重点实验室），四个系分别是：食品科学与工程系、食品生物技术系和营养与食品安全系、葡萄酒学院；七个中心（重点实验室）分别是：农业部农产品质量监督检验检测中心（北京）、农业部转基因生物食用安全监督检验检测中心（北京）、教育部、北京市（共建）功能乳品重点实验室、教育部果蔬加工工程研究中心、葡萄与葡萄酒研究中心、中日农产品加工研究中心、食品技术服务中心。学院现有14000平米的实验办公大楼，除各教授实验室外，还有可容纳500人的报告厅、多媒体会议室、资料室、开放实验室等硬件设备。
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