自治区与行政特区区别：
（1）目的不同：“一国两制”下设立特别行政区是为了解决港澳台问题，使中国的统一大业向前迈进了一大步，也向世界提供了一个以和平方式解决争端的范例。民族自治区的设置是为了解决我国的民族问题，实现民族平等、民族团结、各民族共同繁荣，从而捍卫国家的统一和各民族的共同利益。
（2）地域不同：特别行政区是指“一国两制”下的香港、澳门以及将来回归祖国的台湾等特定地区。民族自治区是指在少数民族聚居的地方实行区域自治，目前我国民族自治区有新疆维吾尔自治区、内蒙古自治区、西藏自治区、宁夏回族自治区、广西壮族自治区
（3）社会制度不同：我国的民族自治区实行社会主义制度；特别行政区是在“一国两制”付诸实施后相当长时间内，在中华人民共和国这个统一主权的国家里，在祖国统一的前提下，实行原有的资本主义制度。
（4）特点不同：特别行政区享有高度的自治权，包括行政管理权、立法权、独立的司法权和终审权，经中央人民政府授权还可以自行处理某些有关的涉外事务。民族自治区享有宪法、民族区域自治法和其他法律规定的经济、文化等方面的自治权。