南京共有35所本科大学，名单分别为南京大学、东南大学、南京航空航天大学、南京理工大学、南京工业大学、南京邮电大学、河海大学、南京林业大学、南京信息工程大学、中国药科大学等，具体完整本科大学名单见下表。
南京本科大学名单一览表
序号 学校名称 主管部门 所在地 办学层次 备注
1 南京大学 教育部 南京市 本科
2 东南大学 教育部 南京市 本科
3 南京航空航天大学 工业和信息化部 南京市 本科
4 南京理工大学 工业和信息化部 南京市 本科
5 南京工业大学 江苏省 南京市 本科
6 南京邮电大学 江苏省 南京市 本科
7 河海大学 教育部 南京市 本科
8 南京林业大学 江苏省 南京市 本科
9 南京信息工程大学 江苏省 南京市 本科
10 南京农业大学 教育部 南京市 本科
11 南京医科大学 江苏省 南京市 本科
12 南京中医药大学 江苏省 南京市 本科
13 中国药科大学 教育部 南京市 本科
14 南京师范大学 江苏省 南京市 本科
15 南京财经大学 江苏省 南京市 本科
16 江苏警官学院 江苏省 南京市 本科
17 南京体育学院 江苏省 南京市 本科
18 南京艺术学院 江苏省 南京市 本科
19 三江学院 江苏省教育厅 南京市 本科 民办
20 南京工程学院 江苏省 南京市 本科
21 南京审计大学 江苏省 南京市 本科
22 南京晓庄学院 江苏省 南京市 本科
23 南京特殊教育师范学院 江苏省 南京市 本科
24 南京森林警察学院 国家林业局 南京市 本科
25 东南大学成贤学院 江苏省教育厅 南京市 本科 民办
26 金陵科技学院 江苏省 南京市 本科
27 南京大学金陵学院 江苏省教育厅 南京市 本科 民办
28 南京理工大学紫金学院 江苏省教育厅 南京市 本科 民办
29 南京航空航天大学金城学院 江苏省教育厅 南京市 本科 民办
30 中国传媒大学南广学院 江苏省教育厅 南京市 本科 民办
31 南京工业大学浦江学院 江苏省教育厅 南京市 本科 民办
32 南京师范大学中北学院 江苏省教育厅 南京市 本科 民办
33 南京信息工程大学滨江学院 江苏省教育厅 南京市 本科 民办
34 南京审计大学金审学院 江苏省教育厅 南京市 本科 民办
35 江苏第二师范学院 江苏省 南京市 本科
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