1、投保对象不一样。新农合是针对农村人口实行的医疗制度，医保是针对城市居民及企业职工（分为居民医保和职工医保两种）；
2、缴费标准不一样。新农合和居民医保的缴费虽然每年是固定的金额，但职工医保则跟个人工资以及当地平均工资挂钩；
3、报销比例不一样。很多地方已经开始实行城镇居民医保和新农合统一的政策了，新农合的报销比例也在逐渐往医保报销比例上靠近；
4、报销范围不一样。医保报销范围比新农合广，像新农合在一些大医院门诊就不能报销，但也是上面提到了的统一政策，新农合的报销范围也正在向城镇居民医保靠拢。
城镇居民医疗保险是以没有参加城镇职工医疗保险的城镇未成年人和没有工作的居民为主要参保对象的医疗保险制度。它是继城镇职工基本医疗保险制度和新型农村合作医疗制度推行后，党中央、国务院进一步解决广大人民群众医疗保障问题，不断完善医疗保障制度的重大举措。它主要是对城镇非从业居民医疗保险做了制度安排。这一制度的出现在中国社会保险制度改革的历程中具有重大意义，指明了中国社会保险制度改革的方向。
职工医保和居民医保的区别如下：
1、两者的概念不一样；
2、二者保障的对象不一样，职工医保的保障对象是企业的职工，而居民医疗保险的保障对象是城镇和乡村的居民；
3、二者的缴费标准不一样，职工医保是由用人单位和职工按一定的比例按月来缴费，居民医保一般是一年一次；
4、缴费的对象不一样；
5、缴费的年限也不一样；
6、待遇不一样。
【法律依据】
《中华人民共和国社会保险法》
第二十六条 职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。
【温馨提示】
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城镇居民医保和农村合作医疗不一样，两者各有特点，新农合属于卫生系统管，而城镇医保属于社保系统管，两个系统不一样。
城镇医保包括城镇职工医保与城镇居民医保这两种。
城镇居民医疗保险是以没有参加城镇职工医疗保险的城镇未成年人和没有工作的居民为主要参保对象的医疗保险制度。
城镇职工医保即城镇职工医疗保险（也有简称为城镇医保的）。城镇职工医保基本医疗保险费由用人单位和职工共同缴纳。
新型农村合作医疗，简称“新农合”，是指由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方式筹集资金。
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扩展资料：
新农合在一些乡镇的卫生所和县城的小医院门诊可以报销，但是在大医院的门诊都不能报，只有住院费用能报。
医保是门诊和住院都能报销，医院等级越高、报销比例越低，医疗费用越高、报销比例越高。不过每年都有报销起付线，比如北京市门诊每年费用超过1800元的部分才能报、住院每年超过1300元的部分才能报，在此范围内都是自费。
参考资料：/baike.baidu.com/item/城镇居民医疗保险/6633730?fr=aladdin"target="_blank">城镇居民医疗保险-百度百科新型农村合作医疗"href="https://baike.baidu.com/item/新型农村合作医疗"target="_blank">百度百科/新型农村合作医疗