1、非营利组织的资源提供者不享有该组织的所有权。企业会计按持股比例对企业的资产享有所有权。
2、非营利组织无实收资本，企业会计有实收资。非营利组织对组织权益称为净资产，企业会计称之为所有者权益。非营利组织将净资产分为非限定性净资产和限定性净资产，企业会计将所有者权益分为实收资本、资本公积、盈余公积和未分配利润。
3、非营利组织是向社会提供公共物品或服务作为一项政府职能来完成的,不以营利为目的。企业会计是以企业利润最大化为目的。
4、企业会计要遵循会计基本原则，非营利会计必须严格尊守经国家权利机关或上级部门批准的预算收支，资金的管理和使用要受到一定的限制。
5、企业会计采用权责发生制作为会计处理原则， 非营利组织会计则以收付实现制为会计处理原则。
6、企业会计必须进行成本核算，非营利组织视情况进行成本核算也可以不进行成本核算。
7、非营利组织会计分为财政总预算会计、行政单位会计和事业单位会计三个部分。企业会计按企业的性质，有商业企业会计、工业企业会计、农业企业会计、施工企业会计和交通运输企业会计等。
非营利组织的作用：
1、社会服务。为社会成员提供中介服务和直接服务。
2、社会沟通。为政府与企业、政府与社会之间的沟通充当桥梁。一方面，向政府反映企业、社会的意见、建议，为政府提供信息；另一方面，协助政府作好宣传、指导、监督等方面的工作。（如各种行业协会）
3、社会评价。对生产、消费品作出公正的评价（如各种调查机构）。
4、社会裁断。调解社会成员之间的纠纷，如消费者权益保护协会。
5、政治作用。政府合法性的资源供给者，合法性就是人们对享有权威的人们的地位的承诺和对其命令的服从。
6、政府权力的监督者。非营利组织为人们的自由结社提供了自我组织的空间，这些组织以公共利益为目标，以保护人类整体利益为宗旨，通过有组织的活动，唤起公众的公共意识，影响政府的公共决策。
7、民主价值观的培育者。有利于培养公众的正确的参政观。
政府与非营利是向社会提供公共物品或服务作为一项政府职能来完成的,不以营利为目的。企业会计是以企业利润最大化为目的。
政府与非营利预算是刚性的，对财务活动具有硬性约束作用。企业的预算相对来讲既有一定弹性，可以根据经营业务活动变动情况调整预算.
政府会计是指用于确认、计量、记录和报告政府和事业单位财务收支活动及其受托责任的履行情况的会计体系。
政府会计是指用于确认、计量、记录和报告政府和事业单位财务收支活动及其受托责任的履行情况的会计体系。本回答被网友采纳
1、服务主体不同
企业会计服务主体以企业为主体，以其经营资金运动为对象，旨在提高企业经济效益的一种管理活动。非营利组织会计服务主体是政府机构和其他不以营利为主要目的的组织（如学校、医院、科研机构、图书馆和慈善机构等）。
2、分类不同
企业会计按企业的性质，有商业企业会计、工业企业会计、农业企业会计、施工企业会计和交通运输企业会计等。按会计内容和侧重面，有财务会计和管理会计。非营利组织会计分为财政总预算会计、行政单位会计和事业单位会计三个部分。
3、核算基础不同
企业会计用权责发生制作为记账基础，正确核算盈亏。非营利组织会计目前确认采用收付实现制，适当的结合运用权责。
参考资料来源：百度百科-非营利组织会计
参考资料来源：百度百科-企业会计
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