法律分析：如果公安局查到了行为人拥有两个户口，应当注销多余的户口，注销户口的手续通常也是按照登记时间的先后顺序来进行的，一般是注销之后登记注册的户口，之前登记的户口则依法成立生效。
法律依据：《公安机关户籍身份信息核查工作规范》
第四条 对历史政策原因造成一人多户，出生日期不一致的，分类处理：1、户口发生多次迁移，且迁入手续都规范完整，按照户口登记时间先后顺序，注销其后登记的重复户口；2、属久居，且找不到原始资料、已经无法查证原因的重复户口，在认真调查的基础上，在群众承诺不再申请更正出生日期和姓名的前提下，可按群众意愿提出申请，保留其中一个户口。
第五条 核查对象拒不配合实情调查或无法联系的，在派出所民警认真调查并出具入户调查报告的基础上，保留有婚姻登记和单位或先申领居民身份证的户口，注销另一方未发现有违法行为的户口。