颜色不同：朱砂是大红色，有金刚光泽至金属光泽。鬼子红，是一种绿色晶体(遇水紫红)，阳光下呈绿色荧光。
溶解性不同：朱砂溶于硝酸。鬼子红微溶于水，易溶于酒精等有机溶剂。
化学结构不同：朱砂主要成分是HgS，鬼子红化学式是C20H20ClN3 。
朱砂：又称辰砂、丹砂、赤丹、汞沙，是硫化汞（化学品名称：HgS）的天然矿石，大红色，有金刚光泽至金属光泽，属三方晶系。朱砂主要成份为硫化汞，但常夹杂雄黄、磷灰石、沥青质等。朱砂有无镇静催眠作用，认识不甚一致；有解毒防腐作用；外用能抑制或杀灭皮肤细菌和寄生虫。 朱砂为汞的化合物，汞与蛋白质中的疏基有特别的亲合力，高浓度时，可抑制多种酶和活动。进入体内的汞，主要分布在肝肾，而引起肝肾损害，并可透过血脑屏障，直接损害中枢神经系统.
鬼子红：碱性品红原为桃红色，当与亚硫酸作用时还原，使醌型变为苯型，由桃红色变为无色透明的N-亚磺酸亚硫酸副品红碱，当它与醛基作用时，其分子式又恢复为醌型结构，呈现紫红色。鬼子红在东北常被用来当作特效的胃药来使用，食用剂量一般在3-5g，使用后，口腔会变成红色，大便小便会变红，食用周期不宜超过10天，治好不少的胃病。由于是化学药品，建议不要轻易食用，出现急性胃病，疼痛难忍时在口服。另外对口腔溃疡，口疮更是有效果，一天涂抹一次，3天即可痊愈。