辅酶是一类可以将化学 基团从一个酶转移到另一个酶上的有机小分子，与酶较为松散地结合，对于特定酶的活性发挥是必要的。有许多
维他命及其衍生物，如
核黄素、硫胺素和
叶酸，都属于辅酶。这些化合物无法由人体合成，必须通过饮食补充。不同的辅酶能够携带的化学基团也不同：NAD+或NADP+携带氢离子，辅酶A携带乙酰基，叶酸携带甲酰基，S-腺苷基蛋氨酸也可携带 甲酰基。
定义
与酶蛋白结合疏松，用透析法容易与蛋白部分分开的有机小分子。
由于辅酶在酶催化反应中其化学组分发生了变化，因此可以认为辅酶是一种特殊的 底物或者称为“第二底物”。这种所谓的第二底物可以被许多酶所利用。例如，目前已知有约七百种酶可以利用辅酶NADH进行催化。
在细胞内，反应后的辅酶可以被再生，以维持其胞内浓度在一个稳定的水平上。例如，NADPH可以通过
磷酸戊糖途径和甲硫氨酸腺苷基转移酶作用下的S-腺苷基蛋氨酸来再生。由于辅酶的再生对于维持酶反应体
系的稳定是必要的，因此，辅酶 再生系统获得了大量的实验室以及工业应用。
常见的辅酶
硫胺素
即
维生素B1。它在生物体内的辅酶形式是 硫胺素焦磷酸 (TPP)（图1[硫胺素焦磷酸(TPP)的 结构式]）。
硫胺素焦磷酸过去也称为 辅羧酶。它在动物糖代谢中起着重要作用，例如
丙酮酸在脱羧作用时需要它。在TPP缺少的情况下,代谢中间物丙酮酸不能顺利 脱羧会积聚于血液和组织中而出现神经炎症状。TPP 还是其他酶例如 -酮酸氧化酶、 转酮醇酶的辅酶。TPP催化的酶反应还需要有 镁离子的存在。
烟酰胺
是一系列酶类的辅酶的前体。
很早就知道烟酰胺可以防止糙皮病。1904年已知酒精发酵时不能缺少一种叫 辅酶Ⅰ的物质，1933年这种辅酶Ⅰ被分离出来。1934年德国生化学家O.瓦尔堡又分离出一个与辅酶Ⅰ相近似的物质，称为 辅酶Ⅱ，并证实了烟酰胺是这两种辅酶的组成部分，现在已经弄清楚辅酶Ⅰ的化学组成是 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 (NAD），辅酶Ⅱ的化学组成为
烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP)。
以NAD(和NADP(为辅酶的酶,称为 吡啶核苷酸（或烟酰胺核苷酸）连接的脱氢酶。这些酶催化细胞内的
氧化还原反应。一般说来，与NAD(相连的脱氢酶类通常与呼吸过程有关，而与NADP(相连的则与 生物合成反应有关。
辅酶I
（NAD）
化学名为烟酰胺腺嘌呤二核甘酸或二磷酸烟苷，在
哺乳动物体内存在氧化型（NAD+）和还原型（NADH）两种状态，是人体氧化还原反应中重要的辅酶。同时，它是NAD+依赖型ADP核糖基转移酶的唯一底物，这类酶在体内主要有三种：1.ADP核糖基转移酶或聚核糖基聚合酶（PARP）；2.环ADP核糖合成酶(cADPR synthases) ；3.III蛋白型
赖氨酸去乙酰化酶Sirtuins。这类酶将辅酶I（NAD+）作为底物分解成ADP核糖和烟酰胺（Nam），在不同细胞中发挥不同生理功能[2]。
核黄素
即
维生素B2。参与组成两种辅酶,是细胞内的氧化还原系统的主要成分,它们是黄素单核苷酸(FMN)和 黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)。
FMN和FAD是一系列黄素连接的氧化还原酶或称为 黄素蛋白类的辅酶，从它们与 酶蛋白结合紧密的程度来说，也可认为是辅基。这些酶中有的除了FMN或FAD外，还需要一些金属辅助因子，如铁或钼离子等。因此它们被称为 金属黄素蛋白。这些酶催化一系列可逆或不可逆的细胞中的氧化还原反应。
吡哆醛及其衍生物
吡哆醛、 吡哆胺和 吡哆醇总称为
维生素B6（图3[维生素的结构式]的结构式"class=image>）。维生素B6参与形成两种辅酶，即吡哆醛磷酸和吡哆胺磷酸。
需要 吡哆醛磷酸或吡哆胺磷酸作为辅酶的酶在氨基酸代谢中特别重要，催化 转氨、 脱羧以及消旋作用等。