有南京大学、南京师范大学、河海大学、南京艺术学院、南京工业大学等。
1、南京大学
南京大学（Nanjing University），简称“南大”，是中华人民共和国教育部直属的全国重点大学，位列“世界一流大学建设高校A类”、“211工程”、“985工程”。
截至2020年5月，学校有仙林、鼓楼、浦口、苏州四个校区；设有31个直属院系，88个本科专业；博士后流动站38个，一级学科博士点40个，二级学科博士点1个。
2、南京师范大学
南京师范大学（Nanjing Normal University），简称南师、南京师大，坐落于六朝古都南京市，是江苏省人民政府和中华人民共和国教育部共建的重点大学，首批国家“211工程”重点建设高校。
截至2020年3月，学校拥有仙林、随园、紫金三个校区，随园校区有着“东方最美丽的校园”之美誉；学校占地面积2179633平方米，校舍总建筑面积932076.19平方米。
3、河海大学
河海大学（Hohai University），简称“河海（HHU）”，是以水利为特色，工科为主，多学科协调发展的教育部直属，教育部、水利部、国家海洋局与江苏省人民政府共建的全国重点大学。
据2019年4月学校官网信息显示，学校在南京市、常州市设有西康路校区、江宁校区和常州校区，占地面积近2580亩；开设56个本科专业。
4、南京艺术学院
南京艺术学院（Nanjing University of the Arts）简称“南艺”，位于江苏省南京市，是中华人民共和国文化和旅游部与江苏省人民政府共建高校，是江苏省唯一的综合性艺术院校。
截至2020年9月，学校座落于南京主城区内，占地700余亩，校舍面积30万平方米；设有14个二级学院，38个本科专业；在校生总数11000余人。
5、南京工业大学
南京工业大学（Nanjing Tech University），坐落于江苏省南京市，是国家国防科技工业局、住房和城乡建设部与江苏省人民政府共建高校。
截至2020年6月，学校有丁家桥校区、虹桥校区和江浦校区，总占地面积近4000亩。截至2020年8月，学校设有11个学部、28个学院，开办本科专业（方向）92个。
参考资料来源：百度百科——南京大学
参考资料来源：百度百科——南京师范大学
参考资料来源：百度百科——河海大学
参考资料来源：百度百科——南京艺术学院
参考资料来源：百度百科——南京工业大学
南京共计51所大学，其中本科学校34所，专科学校17所，有南京大学、东南大学、南京航空航天大学、南京理工大学、南京工业大学、南京邮电大学、河海大学、南京林业大学、南京信息工程大学、南京农业大学、南京医科大学、南京中医药大学、中国药科大学、南京师范大学、南京财经大学、江苏警官学院、南京体育学院、南京艺术学院等。