一般而言，果树根系对磷素的吸收利用能力较强。根系是以主动吸收的方式，吸收土液中的正磷酸盐，由于果树根系的分泌物溶磷能力较强，所以水溶性、柠檬酸溶性甚至部分难溶性磷酸盐，根系都能很好地吸收利用。根系吸收正磷酸盐，直接参与各种新陈代谢作用，迅速转化为有机磷化合物，在树体中可以向各个方向运转，既可向上，又可向下，可以从老叶向新叶，又可以从幼叶向老叶转运。
树体中重要的有机磷化合物有磷脂、核酸、三磷酸腺苷和植素等。磷脂是生物膜的主要成分；三磷酸腺苷是用来贮存叶绿素等色素所吸收的光能，以及呼吸作用所产生的化学能，为养分的吸收及各种有机物质的合成提供能量；植素作为磷的一种贮存形式，主要存在于种子中，当种子萌发时可迅速地运输到幼嫩而旺盛生长的组织中去，为幼苗生长提供磷素营养。
在果树年周期中，磷素营养对氮素营养的调节作用非常重要。早春，如果树体磷素丰富，可促进根系的生长和提高其吸收能力，可促进根系吸收更多的氮素。在果树施肥中，应特别注意树体的磷素水平，找出氮、磷肥的最佳配比。