闽南的寺庙大致可分为三类：第一类的名山名寺的全国性寺庙。如厦门的南普陀，泉州的开元寺，漳州的南山寺等，这种寺庙为数不多，是宗教活动的正规场所，信教群众可以常年去祭祀，又是一个地方的重要旅游胜地，有一套完备规范的管理制度，因而，这类寺庙，不会产生负面的社会影响，而且还会对一方的文明建设产生积极的推动作用。第二类是有一定知名度的区域性寺庙。如湄州的妈祖庙，平和的三坪寺，安溪的清水岩，龙海的白礁慈济宫，东山的关帝庙等，这类庙，为数比第一类多，具有地方特色，一是以纪念造福于一个历史人物而修建的寺庙，且年代比较久远，大多数已被省列为文物保护单位。这些寺庙在闽南一区影响很大，对台湾省及东南亚地区也有一定的影响。这类寺庙活动只要加强管理、积极引导，就能促进与海外乡亲的民族认同和感情沟通，推动对外对台的文化交流与合作。第三类是地方性的寺庙。这种寺庙为数众多，种类繁多，供奉的神明五花八门，主要有文庙、关帝庙、观音庙、城隍庙、先农宫、慈济宫、天后庙、妈祖庙、天妃庙、将军祠、威惠庙、惠民祠、圣土庙等，以村落姓氏为主的家庙等；地方性庙宇由于情况比较复杂，鱼目混珠，使一些基层领导干部难于分清修建整修庙宇及其活动，到底是封建迷信活动，还是民俗活动；到底是联络海外三胞感情，还是恢复宗法宗族势力；到底是保护文物，还是乱修滥建庙宇。这就使得许多基层领导干部群众之间关系的紧张，激发社会矛盾，引起社会情绪的被动，最终还是只能压住一时，难于有持久的社会效果，极易产生回潮。或是采取放任不管态度，一放就乱，酝成乱修滥建庙宇之风愈演愈烈，泛滥成灾，结果那些神棍、巫婆、庙首、不法分子操纵了一切庙会活动，把社会风气搞得乌烟瘴气，群众同样怨声载道，不利于社会安定。
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