淮安汽车站提供了广泛的客运班线服务，覆盖了多个周边地区。乘客可以选择前往淮安机场，涟水、蒋庵、方渡等城市，这些地方的班车服务便捷，满足了不同出行需求。对于临近的县区，如高沟、麻垛、杨口和盱眙，也有直达的班次。此外，铁山寺、金湖、洪泽以及仁和、岔河等地的乘客也能在这里找到合适的车次。
更远一些的城市，如蒋坝、三河、宿迁、泗洪，也有汽车站提供的直达服务。对于江苏其他地区，如沭阳、泗阳和洋河，乘客同样可以在这里乘坐前往的班车。马厂、周集、侍岭、里仁、新袁等地同样被纳入了服务范围，方便了当地的居民和游客。
对于跨省出行，汽车站还提供通往南京、江都、临泽、宝应等地的班车，满足长途旅行的需求。如需更远距离的旅行，比如阜宁、北沙、八滩等地，也有相应的班车服务。还有一些特定的区域，如马荡、康庄，也设有班次。
除了江苏省内的线路，淮安汽车站还连接了上海、义乌等外地城市，以及临近的安徽城市如天长、明光和来安，为乘客提供了跨区域的出行选择。
淮安汽车客运站（总站）设有售票厅、第一候车厅、第二候车厅，并设置了问询处、小件寄存处、茶吧、特殊旅客候车处、商品部、洗手间、饮水处、吸烟处等设施。