在基因组可视化领域，尽管实际项目并不多，但它们却极具代表性。除了常见的基因组浏览器，还有多种专门化的方向，如chip数据的直观呈现、比较基因组学数据的可视化，以及与进化相关的基因树展示等。
基因组浏览器根据使用环境主要分为两类：一是桌面版，如CGView，它以其高效易用著称；另一是网络版，包括了：
此外，还有专门用于创建基因组数据图形的软件包，如著名的Circos，它以美观的环形图展示基因关联信息。
在进化树的可视化方面，也有相应的工具包，如treeview，它为生物学家提供了展示进化关系的有力工具。这些工具包通常包含在更广泛的科学计算软件套件中，帮助研究人员深入理解基因组的演变历程。
基因组可视化基因组可视化，即对基因组数据进行可视化，通常指对最基本的基因组DNA序列，和注释数据等基因组相关的分析数据，按照一定的用户友好方式，使用图形元素表达出来，方便视角直观地识别已知或未知的数据模式，或者比较差异等。 典型的基因组可视化方式有基因组浏览器，Circos软件包绘制等。