1949年，中华人民共和国成立后，长清县划为11个区、94个乡。1950年，长清、河西两县合并统称长清县，全县划为17个区，黄河以东划为第一至第八区和第十七区9个区；黄河以西划为第九至第十六区8个区。
1952年11月，并17个区为15个区。1956年，将长清县所属黄河以西1个区，划归齐河县，全县改为1个镇、11个区、94个乡。1957年调整为1个镇52个乡。
1958年，将全县改划为18个乡镇。1958年，人民公社化运动中，取消乡镇成立人民公社，全县设10个人民公社。
1959年2月，张夏、崮山两公社合并为张夏公社，全县设9个公社。1959年10月，撤消长清县，原孝里公社划属平阴县，双泉、马山、五峰公社划属平阴县，其余各公社划入历城县。
1961年5月，恢复长清县建制。1962年，五峰、马山两公社合并为马山公社，全县共设8个公社。1976年8月，恢复崮山公社和五峰公社，全县共设10个公社。
1982年2月，将全县划为1个镇9个人民公社。1984年2月，撤消人民公社，全县划为9个区、1个区级镇、31个乡、5个乡级镇、610个村民委员会、743个自然村。1985年，区划调整时，设立武家庄乡，全县划为7个镇、4个乡，共有611个行政村。
1995年4月，撤消马山乡、五峰山乡，同时设立马山镇、五峰山镇，全县共辖9镇、2乡、613个行政村。
2001年6月26日，撤消长清县，设立济南市长清区，辖长清、平安店、归德、孝里、马山、五峰山、万德、张夏、崮山9镇和双泉、武家庄2乡、613个行政村。
2003年11月，撤消长清、平安店、崮山、五峰山四镇，同时成立文昌、平安、崮山、五峰四个街道办事处。2005年12月，万德镇、武家庄乡合并为万德镇。
2008年，长清区下辖4个街道：文昌街街道、崮云湖街道、平安街道、五峰山街道5个镇：归德镇孝里镇万德镇张夏镇马山镇。2个乡：双泉乡武家庄乡。 境内粮、油、菜、瓜、果、肉、禽、蛋、奶、鱼等农副产品种类齐全，主要粮食作物有小麦、玉米、谷子、甘薯，主要畜禽产品有猪、牛、羊鸡，主要经济作物有花生、元葱、甘蓝、无核葡萄、中华寿桃、泰山白梨、玉杏、核桃、板栗、柿子等。
