华南理工大学生物科学与工程学院的本科专业有悠久的历史，自1952年国家院系调整成立微生物工学专业以来，经过52年的本科教学发展建设，在国内生物工程学科中，已经具有一定的影响,与国内同类学科相比，有较鲜明的特色和一定的优势。目前本学院设置有生物工程、生物制药、生物技术和生物医学工程四个本科专业，是理、工结合的交叉前沿学科，是21世纪带头学科—生命科学的重要支柱。学院除以本科教学为主的学科外，还包括研究生高层次的教育，目前本学院有两个博士点、五个硕士点。
生物科学与工程学院（原生物工程系）本科教育工作取得了令人瞩目的成就，为国家，尤其是广东省的科技、教育、经济和社会的发展输送了一大批急需的高素质专门人才。他们中的大多数锐意进取、勇于开拓，在研究能力、创新意识、学术水平、组织管理才能等方面表现出众，成为各自工作单位的骨干力量。
在生物技术研究和应用领域中同样有着辉煌的成果，50年代在组合微生物固体发酵、调味品发酵、氨基酸发酵和酒精发酵技术与设备方面的研究就取得了显著成果，使得华南理工大学的工业发酵学科在全国享有盛名。80年代在酶和细胞固定化技术和酶法淀粉转化技术领域在国内作了开创性的工作。90年代，在国际上率先报道了醇脱氢酶催化有机硅化合物的不对称羰/羟基转化和醇腈酶催化有机硅氰醇的不对称合成的新反应体系，具有重要学术意义和应用价值。并以此建立了较完善的基于新型生物催化反应的生物制药体系。 近年来，借助华南理工大学高水平大学建设的契机，加大了改革力度，从国外引进大量高水平人才，建立了基于生物信息学的药物、酶和抗体设计、筛选的新技术体系。在生物大分子筛选、可再生资源利用和生物能源生产技术方面开展了扎实的基础工作，并取得突破性进展。通过新的人才机制，还聘请了一批具有较强生物医药技术研究开发背景的中青年科学家，进一步增强了学科建设的人才和技术力量。
学院拥有广东省名牌专业生物工程,2010年该专业进入高等学校特色专业建设点,“酶工程”被评为国家精品课程。在本科生的培养过程中始终贯穿“ 秉承工科特色，加强理学研究 ”的办学理念，培养“未来型和实用型工科生物科学人才”。 紧密结合国家和广东经济社会发展重大需求，不断推进科技创新与人才培养模式创新，通过组建各类创新班对学生实施优才优育。我院与深圳华大基因研究院共同组建“基因组科学”创新班2年多来，该班先后共有31人次以共同第一作者或署名作者身份在《Nature》、《Science》等国际顶尖学术期刊上发表高水平论文22篇。为进一步巩固双方已有合作成果并推动双方在人才培养、师资队伍、科学研究、学科平台以及国际化等方面的深入合作，2010年4月共建“华南理工大学－深圳华大基因研究院”生命科学创新学院”， 创新学院挂靠我院，共同开展本科生、研究生及青年教师的培养。
乘广州市大学城建设的东风，华南理工大学已在南校区投入5000万元，建设10000平方米的生物科学与工程学院教学和科研大楼，为学科的教学与建设以及学科的发展提供了良好的物质条件。
