当新购车辆两年内，遇到一把钥匙能遥控门，另一把失效的情况，可能由以下几个原因引起：
首先，遥控钥匙电池电量可能耗尽。请留意遥控钥匙上的信号灯，若亮度正常，则表明电池电量尚可，无需更换。若亮度暗淡，应及时更换。
其次，遥控钥匙可能存在失灵问题。如果两把钥匙均无法解锁车门，可能是遥控器功能出现了故障。此时，您需要携带车辆前往4S店进行遥控器的重新配对。
再者，可能是车辆接收器出现了故障。如果遥控钥匙无法正常工作，即使更换电池或配对遥控器，问题依然存在，那可能需要检查车辆的接收器部分，这通常需要专业的4S店进行诊断和维修。
为了确保遥控钥匙的正常使用，建议您在每次使用前检查电池状态，及时更换耗尽的电池。若遥控器出现问题，应尽快联系专业服务。若车辆接收器故障，务必及时前往4S店寻求专业维修，以避免进一步的不便和损失。