两者的区别是：一个是偏管理的，一个是偏审计的。财务管理更侧重于企业财务事前的筹划规划，整体的控制，而注册会计师更侧重于时候企业的审计和咨询等业务。
一、财务管理
财务管理是在一定的整体目标下,关于资产的购置(投资),资本的融通(筹资)和经营中现金流量(营运资金),以及利润分配的管理。
财务管理包括以下几个部分：
筹资管理
投资管理
营运资金管理
利润分配管理
财务管理是基于企业再生产过程中客观存在的财务活动和财务关系而产生的，是企业组织财务活动、处理与各方面财务关系的一项经济管理工作。
它通过对资金运动和价值形态的管理，像血液一样渗透贯通到企业的生产、经营等一切管理领域。
二、注册会计师
注册会计师是指取得注册会计师证书并在会计师事务所执业的人员，英文全称Certified Public Accountant，简称为CPA，指的是从事社会审计/中介审计/独立审计的专业人士。
注册会计师的职能：
独立审计。根据我国《注册会计师法》规定，注册会计师主要承办以下审计业务：
审查企业财务报告，出具审计报告。这是注册会计师业务的主要部分。在审计财务报告时，注册会计师要对形成财务报告各项目数据的资料及其所反映的经济业务进行审计；为了提高审计质量和效率，还需对与生成财务报告密切相关的内部控制制度进行研究和评价，确定审计的重点领域。注册会计师在根据独立审计准则的要求，完成了预定的审计程序，取得了相应的审计证据后，应编制和出具审计报告。审计报告主要表述注册会计师的审计意见，具有法定证明效力，无须任何部门或单位的审定。注册会计师及其所在的会计师事务所对其出具的审计报告要承担相应的法律责任。
办理企业合并、分立、清算事宜中的审计业务，出具有关报告。企业在合并、分立或终止清算时，应当按照法律、行政法规的规定，分别编制合并时或分立时的财务报告以及清算财务报告。为了帮助财务报告使用人确定对这些报告的依赖程度，企业需要委托注册会计师对其编制的报告进行审计，并出具审计报告，其审计、报告同样具有法定证明效力，承办注册会计师及其所在的会计师事务所应当承担相应的法律责任。
法律、行政法规规定的其他审计业务。前述两项审计业务，基本是以财务报告为直接审计对象，其审计目的是对财务报告的公允性、合法性和一贯性表示审计意见。这些业务是注册会计师审计业务的主要内容，因此，常将这类财务报告审计业务称为一般目的审计业务。在实际工作中，注册会计师还可根据法律、行政法规的规定，接受委托对财务报告以外的其他特定事项进行审计，包括对按照特殊编制基础编制的财务报告进行审计，对财务报告的组成部分进行审计，对法规、合约遵循情况进行审计，对按照法规或者合约编报的会计资料进行审计，对简要财务报告进行审计等。这种特定事项的审计，通常称为特殊目的审计业务。注册会计师办理特殊目的审计业务，也需要出具审计报告，且审计报告同样具有法定证明效力，注册会计师及其所在的会计师事务所对此也应当承担相应的法律责任。
2．验资。验资是指注册会计师依法接受委托，对被审验单位的实收资本（股本）及其相关的资产、负债的真实性、合法性所进行的验证。企业申请开业，重要条件之一，就是必须有一定的注册资本，这是企业对外开展经营活动的信用基础。为了保证注册资本的真实性，企业筹集的资本必须聘请注册会计师验资并出具验资报告，以此作为投资人缴纳出资的证明，同时也是界定企业产权关系和维护社会经济秩序的有效手段。
3．管理咨询。管理咨询，是注册会计师的一项重要业务。注册会计师所进行的管理咨询，是凭借其专业优势，受托或主动服务于经营者或经济管理者，为其在建立健全内部管理制度和会计制度、进行经营诊断、建立电算系统、组织人员培训以及对重大经济决策和重要项目的实施进行论证、评价等方面提供咨询服务管理咨询的积极作用主要在于：为客户提供政策咨询，促进客户依法经营；为客户提供业务咨询，帮助客户提高经济效益；为客户提供信息咨询，增强客户的竞争力。
注册会计师所进行的管理咨询，其内容比较广泛，主要包括设计会计制度、税务代理和税务咨询、资产评估、项目可行性研究和经济评价、企业改制及股票发行与上市咨询、代理工商企业注册登记、代理记账、企业财务诊断、培训财务会计人员等。随着经营管理水平的提高和注册会计师事业的不断发展，管理咨询的服务范围将越来越广。