人类的进化问题是一个古老而神秘的问题，达尔文在他的《物种起源》一书中明确提到“人是由猴子变来的”。随着进化论的普及，“人类的祖先是由猿进化来的”这一观点已经被绝大多数人认可和接受。遗憾的是科学发展到今天，并不能完全解释人类进化的整个过程。
古猿突然间直立起来行走，是人类从猿进化到人的一个非常关键的谜团。从攀爬到直立的跨越式进化，在骨骼上会留下明显的标记，这就需要化石材料来进行说明。露西是一句生活在300万年前的女性骨骼，根据对她的骨骼特征推断，其脑骨骼呈现的是猿脑特征，但她却是直立行走的。这很有可能会填补古猿到人的缺失环节。但另一个问题出现了，古猿为什么会从树林转移到了陆地。人们对此有很多猜测，有人认为，随着进化的不断进行，古猿学会了使用工具，在陆地有更丰富的食物可供它们食用；还有人认为，气候的变化给森林带来了毁灭性的灾害，古猿不得不从树上转移到陆地……但这些都没有科学的依据。遗传学家们正在力求解决这一谜团，要想真正回答这一问题，估计还会需要相当长的时间。
还有一种观点认为人类是由海洋生物进化来的。他们认为婴儿最初在母体中是被羊水包围的，就像生活在大海中一样；除此之外，新生的婴儿对水都有一种天生的喜爱，甚至当把一个从没学过游泳的婴儿放进游泳池中的时候，他们会表现出与生俱来的对水的熟悉和适应。这是很奇妙的现象。甚至有人认为游泳是人们的一种原始本能，是我们遗传记忆中的一部分。这就更加让人们有理由去海洋中探索人类的演变过程。
海洋与人类的生存发展有着非常密切的关系。海洋是生命的诞生和孕育之地，直到现在为止，人们的许多习惯和器官都明显的保留着其他哺乳动物所没有的海洋印迹。有学者认为，人类是从有鳃的动物进化来的，而鱼是世界上最早出现的动物。19世纪末的时候，科学家把目光集中在了圆鳍类身上。它的鳍里有着独一无二的骨结构，就像是人类四肢的前身一样。随着时间和环境的不断变化，掌鳍鱼开始离开海洋，来到了陆地，为适应陆地上的环境，它们的鳍演化成了四肢，并开始行走。鱼石螈就是最早长出腿脚的动物。接下来就有了四足兽，直立兽的演变，最终形成了人类。其实，人的头脑是进化过程中保留最好的证据，而人的头脑恰恰保存了鱼类和爬虫类的脑，不但形状相似，其基本功能也是一样的。因此，也有人说鱼是人类的祖先。
《进化论》频遭质疑，人类究竟是如何出现的