miRNA荧光定量PCR中的内参用什么？

如题所述

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第1个回答 2012-05-11

一般用U6就可以了，当然，针对人、大鼠、小鼠、细胞系，会有不同的更合适的选择

甚至于5S rRNA也是可以用的，只是表达量太高，十几个循环就进入平台期了，对于有些低表达量的样本反而不太适合

第2个回答 2012-05-13

我做的是人血浆miRNA定量检测，用的是线虫miR-39。其他组织一般用U6

第3个回答 2012-05-09

U6

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microRNA的qPCR内参可以用GAPDH吗答：mirna的荧光定量pcr可以用actin做内参miRNA通过与转录本的相互作用，关闭或抑制基因的表达。最近的研究表明它们影响了约三成的基因。miRNA在多个组织中差异表达，这就让表达图谱分析成为研究的重点。同时，miRNA的过表达和抑制也是近年来常用的研究方法。我知道和使用过的U6内参基因只有两个：RNU6-1和RNU6-...

血清中miRNA 实时荧光定量PCR内参的选择?? 及上游引物的序列??答：血清中的miRNA做定量PCR的时候其实没有很好地内参可以用，这跟血清中miRNA的来源有关，我们一般都是提取miRNA的时候，提前加入一定量的某种特殊的人工合成的siRNA，作为外参使用。上游引物的序列还是取决于你想要研究的miRNA，miRNA的qPCR检测，上游引物都是特异性的，下游引物是通用的。

番茄U6基因是什么,做miRNA的qRT-PCR时的内参一般用U6,不知道U6的序列...答：做miRNA的qRT-PCR有茎环法和加尾法，U6很常用，你自己查相关的文献就能看到别人现成设计好的。加尾法的反向引物的通用的，正向引物就拿U6的序列，自己设计就行。序列在下面：Tomato U6 small nuclear RNA gene 1 ataaatcttt ttaatttata gtatatttat gtaagttttc acgttgagta aatagcgaag 61 aagttgggcc...

mirna内参u6猪和人的能通用么答：不能通用。这个和普通的反转录pcr一样，反转录成cDNA第一链，单链再做pcr扩增，逆向引物当然是和反转录引物部分相同，而不是互补。U6是一类核小分子RNA，由RNA聚合酶III启动。做miRNA的qRT-PCR有茎环法和加尾法，U6很常用。

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