mirna的荧光定量pcr可以用actin做内参
miRNA通过与
转录本的相互作用,关闭或抑制基因的表达。
最近的研究表明它们影响了约三成的基因。
miRNA在多个组织中差异表达,这就让表达图谱分析成为研究的重点。
同时,miRNA的过表达和抑制也是近年来常用的
研究方法。
我知道和使用过的U6内参基因只有两个:RNU6-1和RNU6-2.前一个就是常见的u6,后一个有时被称为u6b.在我的大鼠RNA样本当中,u6表达量有些太高,u6b的Cq值与我的目标miRNA比较接近,稳定性也很好.但是这些对植物样本中的内参基因选择没有什么指导意义.
为了确定u6在植物中的保守性,比较快捷的办法是找到谈论这个话题的
文献综述.如果没有人写过这样的综述的话,就只能靠自己去数据库找到所有序列自己对比了.
关于内参基因的选择,必须实验确定特定样本中的表达水平稳定,其他文献中报导的内参基因不一定适合你的样本.做新的课题时,选择内参基因一般是选取3-5个常用的,PCR测试后选取.