清暑祛湿，生津止渴
木瓜性温，酸，入肝、脾经。木瓜能清解暑气，化湿运脾，生津止渴，长夏天气湿热的时候食用，既可防暑降温，化湿运脾，又可补充夏季出汗太多所造成人体的津液不足。
医书云：脾为后天之本。吃水果能帮助消化和吸收，进而巩固脾胃，实在合算。以医理分析，木瓜味甘、性平、微寒，助消化之余还能消暑解渴、润肺止咳。
健脾消食，化积止泻
木瓜有健脾消食的作用。木瓜中的木瓜蛋白酶，可将脂肪分解为脂肪酸。木瓜中含有一种酵素，能消化蛋白质，有利于人体对食物进行消化和吸收，因此有健脾消食之功。吃了太多的肉食，脂肪容易堆积在下半身，木瓜里的酵素，可帮助分解肉食，减低胃肠的工作量，让肉感的双腿慢慢变得更有骨感。
润肤去皱，美容增颜
因为木瓜性温，不寒不燥，其中的营养容易被皮肤直接吸收，特别是可发挥润肺的功能。当肺部得到适当的滋润后，就能更好地行气活血，使身体更易吸收充足的营养，从而让皮肤变得光洁、柔嫩、细腻，皱纹减少、面色红润。
抗痨杀虫，祛除邪毒
木瓜中含有番木瓜碱和木瓜蛋白酶，它们具有抗结核杆菌及寄生虫如绦虫、蛔虫、鞭虫、阿米巴原虫等作用，故可用治肺结核、蛔虫症、阿米巴肝脓肿等。
舒筋通络，解痉止痛
木瓜果肉中含有的番木瓜碱具有缓解痉挛疼痛的作用，对排肠肌痉挛有明显的治疗作用。川木瓜味酸、性微温，主要作用是祛湿痹，舒筋活络，对于风湿痛患者最适宜。
清热润肺，止咳平喘
用熟木瓜和柿饼加水煎服，可治气喘性咳嗽;以熟木瓜去皮，蒸熟后加蜜糖，可治肺燥咳嗽;用生木瓜绞汁或晒干研粉，可驱虫。冰糖木瓜，具有清热润肺的功效，适用于肺热干咳，虚热烦闷等病症。至于番木瓜，生吃能舒缓咽喉不适，对感冒咳痰、便秘、慢性气管炎等亦有帮助。
抗疫杀虫：番木瓜碱和木瓜蛋白酶具有抗结核杆菌及寄生虫如绦虫、蛔虫、鞭虫、阿米巴原虫等作用，故可用于杀虫抗痨。
补充营养，提高抗病能力：木瓜中含有大量水分、碳水化合物、蛋白质、脂肪、多种维生素及多种人体必需的氨基酸，可有效补充人体的养分，增强机体的抗病能力。
通乳抗癌：木瓜中的凝乳酶有通乳作用，番木瓜碱具有抗淋巴性白血病之功，故可用于通乳及治疗淋巴性白血病(血癌)。
抗痉挛：木瓜果肉中含有的番木瓜碱具有缓解痉挛疼痛的作用，对腓肠肌痉挛有明显的治疗作用。