马祖又名马祖列岛，位于台湾海峡正北方，面临闽江口、连江口和罗源湾，与中国大陆只有一水之隔，为海运要冲。主要由南竿岛、北竿岛、高登岛、亮岛、大丘岛、小丘岛、东莒岛、西莒岛、东引岛、西引岛及其附属小岛共计三十六个岛屿、礁屿组成。马祖原分别隶属于福建省连江县、长乐县与罗源县，现由台湾当局的“福建省”“连江县”管辖。
1999年，以马祖列岛为范围的马祖“国家”风景区成立，隶属于台湾当局“交通部”管理。除了地形地貌和人文特色外，因为马祖地理位置关系，成为候鸟过境或渡冬的区域，2000年成立马祖列岛燕鸥保护区，主要针对白眉燕鸥、红燕鸥、苍燕鸥、凤头燕鸥、黑尾鸥、岩鹭、插尾雨燕等7种鸟类。2000年6月曾在此发现在世界鸟类红皮书中被列为临绝种的黑嘴端凤头燕鸥共4对，每年的最佳赏燕鸥季是5月到8 月。
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