区别只有一点就是两个的经营范围不一样。
1、运输公司属于普货，需要但是物流公司的经营范围包括普货还有货物中转。
2、物流公司的范围包括运输公司，且办理的部门也不一样。
它们都要办道路运输许可证的。
办理材料：
（一）工商部门出具的企业名称预先核准通知书或企业法人营业执照复印件。
（二）《道路货物运输经营申请表》[办理道路运输证时另提供《上海市道路运输经营业户基本信息采集表（主表）》、《道路货物运输企业信息登记表》、《道路货物运输车辆信息登记表》]。
（三）负责人身份证明，经办人的身份证明和委托书。
（四）新车须出具购车发票或拟购置运输车辆的承诺书，承诺书应当包括车辆数量、类型、技术性能、购置时间等内容。
（五）聘用或拟聘用驾驶员的机动车驾驶证、从业资格证及其复印件，拟聘用外地驾驶员的须提供本市公安部门发放的《外省市机动车驾驶人登记凭证》。
（六）安全生产管理制度文本。
扩展资料：
一、物流公司运作模式
1、销售部门接到定单，直接给设在中国的工厂下单
2、工厂向物流代理提供料件清单和生产计划
3、物流代理向指定料件供应商发出备货请求
4、物流代理商完成到货的运输、储存和分拣
5、物流代理在指定的时间将料件配送到工厂
6、物流代理将生产的整机按销售部门的要求发给客户
7、销售部门收到货款并支付供货商和物流代理相关费用从接单到交货的整个过程，可以在3-5天内完成，即下单后95%的产品在5天之内送达全球指定地。
二、运输公司
运输首先作为“第三利润源”而引起重视的，所谓第三利润源，是针对企业的利润来源而言的，企业第一利润源来自企业销售额的增加，第二利润源是生产成本（针对制造商而言）或者进货成本（针对流通商而言）的降低，而由降低成本所得的利润则成为企业第三利润源。
在这里，运输被定义为对物资的流通配置，包括制造商、流通商的装卸、运输、仓储、搬运等一系列的过程，对货运的重视被提高到降低成本、增加利润的高度，成为货运定义的第一个转折。
参考资料来源：百度百科-道路运输许可证
参考资料来源：百度百科-运输公司
参考资料来源：百度百科-物流公司
一定。
1、经营范围不同：运输主要是借助一些运输工具，实现货物的转移。按照交通工具的不同，可以分为陆运、铁运、空运、海运、管道运输，按照运输距离的不同，可以分为干线运输、区域配送、最后一公里配送。而物流的范围比较大，凡是参与到物的流动过程中的活动，都属于物流的范围，除了运输之外，还包括，仓储、二次包装、二次加工等。
2、资质不同：如果主营业务是运输业务，那么除了在《营业执照》上的经营范围中体现出来运输相关的业务之外，还要办理《道路运输许可证》，其中道路运输许可证的办理，需要提交公司名下货车的相关资料。如果是作为网络承运人的话（也就是无车承运人），那么需要申请网络承运人的牌照，方可经营无车承运人的运输业务。其中网络承运人需要以物流信息化作为基础。
企业选择物流公司注意事项
企业一定要选择正规的物流公司作为合作伙伴，要避免皮包公司的选择。许多企业都习惯于选择国有性质的物流公司，虽然其服务不周到、态度差，但总归是值得信任的。随着物流公司的增多，物流服务好的公司也地增多，企业更加愿意寻找那些业务范围广、服务服价合理、服务质量好的物流公司。
企业在选择物流公司时最好选择专业的公司。每个物流公司都有其专长，有的物流公司测重于国际货运，而有的物流公司则测重于同城货运。企业要根据不同业务来选择最合适的货运公司。必要时，也可以同时与许多货运公司建立长期的合作伙伴关系，以便用于不同的货运业务需要。
以上内容参考 百度百科-物流公司、百度百科-运输公司、百度百科-道路运输许可证
本回答被网友采纳还有就是物流公司可能要交保证金。本回答被网友采纳
只要运输货物的货车都要办道路运输许可证，否则在路上被交通执法大队查到没证就要罚款了。
这样说应该很通俗可以理解吧。