企业储存柴油自用违法，并且需要去相关部门申请，批准后才能储存。
根据我国相关法律法规规定:
内部自用柴油储油点须取得消防验收合格意见书、安全评价报告（部队内部自用加油站除外）方可储存油品。内部自用加油站以自用名义购买的柴油不得对外销售，违者视同无证经营予以取缔”。
凡以自用名义购买柴油并储存油品的用油单位（包括客运或货运的专业运输企业、机关和企事业单位、厂矿、工地等单位）须向区商务主管部门提供备案登记，如发现有对外销售的违法行为，将按成品油管理的有关规定以及依照无照经营论处，并会同有关部门予以取缔。
单位自用并已私设油罐加油机的，必须于2017年5月1日前向区商务局提供备案登记手续；新设立油罐加油机的需事前向区商务局提出备案申请，通过审核备案登记后方可设立。
备案登记须提供的材料：
1、消防验收合格意见书。
2、安全评价报告。
3、油品供应证明（即购油的发票或货运单）。
4、客运或货运的专业运输车队或机关企事业单位用车的，须有清单并附行驶证复印件。
5、需自用柴油的厂矿，工地购油，须有当地经贸部门现场核实的用油数量意见书。
6、厂矿、工地用油的单位还须有营业执照或单位法人证书，并提供详细运油路线。