作为上海市实验性示范性高中、国家级“绿色学校”、中国可持续发展教育（ESD）项目首批示范学校吴淞中学在生态型基础课程、拓展课程与研究课程，必修课与选修课，主题活动与社团活动，社会实践与校园文化等方面都进行了有益的探索和实践。这些生态型课程形成了学校特色，和谐地作用于学生的成长。学校课程建设促进了学校管理的改革，促进教师了专业化发展，也促进学生主动发展。学校在实践中打造优质教育资源，创造能适应学生主动发展的精细化教育模式，在同类学校中起到示范效应。
吴淞中学开设了在上海市内有较大影响的研究型学习课程，在跨学科教学方面也做了探索。学校每年举办校体育节、科技艺术文化节，为学生综合素质的提高搭建舞台。吴淞中学高考质量始终稳定于上海市实验性示范性高中前列；被北京大学、清华大学录取的学生年度占比在区内名列前茅。王诗涛、庞博等多名同学荣获上海市“明日科技之星”和上海市“科技希望之星”的荣誉称号。
在德、智、体、美全面和谐发展的基础上，吴淞中学还形成了部分强势课程和学科，学校递交的科研课题曾在莫斯科国际青少年科学研究者大会上夺得生命、环境科学组一等奖和大会参赛项目特等奖，在美国波特兰市第55届英特尔国际科学与工程大奖赛决赛中一举夺得英特尔杰出项目成就奖等7项大奖。其中，3位同学的姓名被美国麻省理工学院为小行星命名。2008年10月，吴淞中学组队代表中国高中生赴丹麦首都哥本哈根参加第20届欧盟青年科学家竞赛交流活动，获得了QUIZ奖。
学校先后接待了英国、加拿大、澳大利亚、美国、日本、韩国等国家和澳门等地区的教育考察团来校考察，并与澳大利亚棕榈树海滨区、可伦宾区中学和英国乔治·华盛中学、韩国高阳中学、加拿大维多利亚高中建成了友好姐妹学校。吴淞中学每年引进外教，并组织学生去欧美发达国家学习，派遣骨干教师赴国外友好姐妹学校进行学术交流。学校还曾成功承办“上海地区青少年英才中心夏令营”暨“国际文化夏令营”、国际桥联主席达米亚尼和十多位国际一流桥牌大师参加的“世界桥牌大师走进校园”、美国加州中学生合唱团与中国学生联谊、宝山国际民间艺术节外国艺术家进校园等大型国际交流活动。
