烟台毓璜顶医院拥有一系列重点和特色科室，致力于提供高质量的医疗服务。以下是医院的亮点科室：
呼吸内科作为优势学科，专注于呼吸系统疾病的诊治，为患者提供专业支持。
保健科则关注预防保健，提供全面的健康管理服务。
重症监护室（ICU）确保对紧急和危重病患进行24小时不间断监护和救治。
康复医学科致力于康复治疗，帮助患者恢复健康和功能。
泌尿内科处理与肾脏、尿路相关的疾病，提供专业诊疗。
变态反应科专长于过敏和免疫相关疾病的诊断与治疗。
皮肤科针对各类皮肤问题，提供个性化的治疗方案。
腹部外科和普外科处理各种腹部及普通外科疾病，技术精湛。
小儿外科和骨科分别关注儿童健康和骨骼系统的疾病。
心脏外科、血管外科和肿瘤外科均是高级别的外科团队，擅长复杂手术。
口腔科关注牙齿健康和口腔疾病治疗。
烧伤整形美容科擅长处理烧伤、整形及美容修复问题。
风湿科专研风湿性疾病，提供全方位的治疗和管理。
肿瘤内科针对各种恶性肿瘤提供精准的诊疗和支持。
手足外科、脊柱骨科和创伤骨科专注于手部、骨骼和创伤修复。
市级重点学科包括血液内科和肝胆胰脾外科，提供高级别诊疗服务。
神经外科、眼科和神经内科分别负责神经系统和眼科疾病的治疗。
内分泌科研究和治疗内分泌系统疾病，关注身体的内部平衡。
肿瘤放射治疗科和介入放射科利用现代技术进行精确的放射治疗。
肛肠科专门处理肛门和肠道疾病，提供专业护理。
感染性疾病科关注预防和治疗各种感染，确保患者安全。
麻醉科确保手术过程中的患者安全与舒适。
省级特色学科中西医科，融合中西医优势，提供全面的诊疗服务。
泌尿外科、耳鼻咽喉科、妇科、消化内科、消化内镜、心血管内科和儿内科分别针对各年龄段和特定系统的疾病。
产科和生殖医学中心关注女性生育和生殖健康。
烟台毓璜顶医院是烟台市最大的综合性医疗保健中心、三级甲等医院、青岛大学医学院附属医院、大连医科大学教学医院、烟台市涉外定点医院、山东大学医学院暨青岛大学医学院研究生培养基地。