直接向劳动仲裁部门提出劳动仲裁。
1、必须说明，农民工与包工头之间是形成劳动关系（而不是合作关系，因为包工头的欠条说是欠“工程款”），这点很重要，如果是合作关系，则是经济纠纷而不属于劳动纠纷，经济纠纷属于法院的事。
2、必须强调，自跟包工头后，农民工根据他的工作要求完成工程并接受他的日常管理及人员调配（这点是配合以上第1点）。
3、对于证明，可以说明：
一劳动关系事实存在及建立时间。
二包工头未依法支付劳动报酬；（申请劳动仲裁时必须注明是要包工头支付工资，而不是“工程款”）。
4、如果劳动部门受理，还可以利用包工头未及时支付工资申请以予赔偿金。
法律依据：
1、《建设领域农民工工资支付管理暂行办法》第十二条：工程总承包企业不得将工程违反规定发包、分包给不具备用工主体资格的组织或个人，否则应承担清偿拖欠工资连带责任。
2、《关于确立劳动关系有关事项的通知》第四条：建筑施工、矿山企业等用人单位将工程（业务）或经营权发包给不具备用工主体资格的组织或自然人，对该组织或自然人招用的劳动者，由具备用工主体资格的发包方承担用工主体责任。
3、《劳动争议调解仲裁法》第九条：用人单位违反国家规定，拖欠或者未足额支付劳动报酬，或者拖欠工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金的，劳动者可以向劳动行政部门投诉，劳动行政部门应当依法处理。
4、《劳动保障监察条例》第十七条：劳动保障行政部门对违反劳动保障法律、法规或者规章的行为的调查，应当自立案之日起60个工作日内完成；对情况复杂的，经劳动保障行政部门负责人批准，可以延长30个工作日。
5、同时，农民工也要学会保护自己，不要为包工头的花言巧语所蒙骗，一定要跟他们签定书面依据，当自己的合法权益受到侵害时别受包工头所利用。
通过正当渠道向当地劳动保障监察部门投诉，不要听信包工头的所谓承诺，依法选派代表到相关部门直接投诉就行，别让自己成了包工头要挟相关部门的工具！