根据地理环境采取不同的施工方法。主体工程有混凝土结构、钢结构，也可能都有。浅的地方可能在海上截流下挖建造，这样的造价比在地下挖要省很多钱。不能截流的地方只能下挖，边挖边浇灌混凝土或用钢铁支撑主体。目前国内外海底隧道的施工方法主要有两种:(1)盾构法(一种掘进机)。该法对地面（或海底面）的影响很小。其施工时，主要为盾构掘进机在地层中推进，利用其面的刀盘切割土石并将弃砟运出隧道外，同时拼装预制好的隧道管片（结构）。(2)沉管法。沉管隧道就是将若干个预制段分别浮运到海面（河面）现场，并一个接一个地沉放安装在已疏浚好的基槽内，以此方法修建的水下隧道。目前沉管法施工已经比较成熟，一般与盾构法进行方案比选。
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