幕府时期的天皇权力大小。幕府是古时日本一种权力曾一度凌驾于天皇之上的中央政府机构，常以“挟天子以令诸侯”的方式来进行对国家统治，其最高权力者为征夷大将军，亦称幕府将军。
日本历史上主要经历了镰仓幕府、室町幕府、
江户幕府三个幕府历史时期。 始于1185年终于1867年，共682年。镰仓早期和末期，以及室町初期的天皇还是有很大影响力和一定实权的。但是到室町幕府的三代将军足利义满实现南北统一后，天皇就死心了，安安静静的做日本的“神”，世俗权力则全部掌握在幕府将军的手里。换句或说天皇那时候就是顶着一个非常尊贵的名头混饭吃的。
在幕府的统治下，天皇基本上只有宗教上的权利，政治上没有权，经济上没钱，住的宫殿外面下大雨，里面下小雨，为了避雨，睡一觉要换几个地方。
战国时代，天皇家因为经济困穷，惨到登基多少年之後举行不了登基典礼，甚至死後二十多年不能安葬。天皇靠卖字维持生活，宫女就只能靠卖身了。遇到大臣面圣觐见，天皇还得到当铺里赎朝服。
江户时代 天皇只有一项权力 决定年号 不过总算有四万石的领地
根据网上有人给出的一个例子说是在安土桃山时代初（
织田信长与丰臣秀吉称霸日本的时代），天皇只有五千石的领地，尽管后来丰臣家给他加到了一万，但丰臣家却领有一百三十万石。到后来德川家又加到五万，可幕府竟领有四百万石。江户时代，二十多代将军，除了家康公等几人外，从未给天皇加领。而且天皇平日只有五十个仆人，吃米饭还要加二成糠。