审计一般是不函证“主营业务收入”。而是为了验证企业“主营业务收入”的真实性，一般是通过函证“应收账款”下设的客户来核对的。
可以针对审计对象企业会计帐上设置的“应收帐款”客户明细，选取几个余额较大的客户来进行函证（或应收余额在5万或10万以上的客户发函），核实“应收账款”的真实性。
审计程序中函证从含义上来说是指注册会计师为了获取影响财务报表或相关披露认定的项目的信息，通过直接来自第三方对有关信息和现存状况的声明，获取和评价审计证据的过程。审计程序中函证有其特点，下面是审计程序中函证的具体几个特征和重要表现：
①函证及其替代审计程序仅在银行存款、借款、往来账款的审计中运用
②在审计函证时，注册会计师需要针对具体的账户实施专门的抽凭测试。
③对债务需要进行函证，对债务现时应付数加以判断
④注意正确选择和判断往来账户的重大项目，对年末余额虽为零或很小，但发生额非常大的重要往来账户也必须进行函证。
⑤审计函证时候需要对债权账面余额的认定考虑可回收性。
⑥询证函由注册会计师直接发出并由接受审计业务的会计师事务所回收。
审计程序中函证在审计程序中发挥重要作用，函证取得的证据是证明力较强的审计证据。我们既实施了函证，又进行了必要替代审计程序，各种检查的结果都能印证账面金额，这样的审计证据既可靠，证明力又强，因此审计程序中函证在审计程序中必须要注意以下五个个方面，具体如下：
①注册会计师必须控制整个函证的过程
②熟悉被审单位的业务类型和具体操作规程
③不能凭询证函回函直接确认有关往来账项
④在会计报表截止日后、进点实施审计前，提前发询证函
⑤采用函证后应尽量进行相应的替代审计程序
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