第1个回答 2010-05-09
1.阿笠博士：由柯南告知
2.灰原哀（宫野志保）（TV 129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件 两小时特别篇）：由搜索分析察觉，有阿笠博士告知。
3.服部平次（TV版本57~58福尔摩斯迷杀人事件）：在事件中察觉揭漏。
4.工藤优作（其父）：由阿笠博士转达。
5.工藤有希子（其母）：由阿笠博士转达。
6.贝尔摩德（即Vermouth/苦艾酒，与新一的母亲是朋友，见过新一小时候的照片）
7.怪盗基德（黑羽快斗）（剧场版世纪末的魔术师中化妆成白鸟警官偷听柯南的电话）
8.本堂瑛佑 （柯南亲口承认）
9.宫野明美（Miyano Akemi），即灰原哀（宫野志保）的姐姐 （亲口承认，TV128黑暗组织10亿元抢劫事件，已死）
10.Irish （真实身份未知，已死亡，见剧场版13 漆黑的追踪者，根据指纹对照证实）
11.泽田弘树（见剧场版06《贝克街的亡灵》，但有争议：泽田弘树死后的思想存储在了计算机里，因此有人说是计算机的分析得出了柯南就是工藤新一的结论）
12.鲁邦三世那一伙人
太好看了！
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第2个回答 2010-05-09
1.阿笠博士 2.灰原哀
3.服部平次
4.工藤优作
5.工藤有希子 6.贝尔摩德 7.怪盗基德（黑羽快斗 8.本堂瑛佑 9.宫野明美（Miyano Akemi），即灰原哀（宫野志保）的姐姐 （亲口承认，TV128黑暗组织10亿元抢劫事件，已死）
10.Irish （真实身份未知，已死亡，见剧场版13 漆黑的追踪者，根据指纹对照证实）
11.泽田弘树（见剧场版06《贝克街的亡灵》，但有争议：泽田弘树死后的思想存储在了计算机里，因此有人说是计算机的分析得出了柯南就是工藤新一的结论）
12.鲁邦三世那一伙人
13.FBI等人可能知道
参考资料：http://baike.baidu.com/view/4459.htm#5
第3个回答 2010-05-03
1.阿笠博士（陷入困境的柯南亲口承认）
2.灰原哀（宫野志保）（作为APTX-4869的发明者，调查加推理得知）
3.服部平次（柯南的推理能力太强被发现）
4.工藤优作（阿笠博士告诉的)
5.工藤有希子（阿笠博士告诉的)
6.贝尔摩德即Vermouth（与新一的母亲是同事也是朋友，见过新一小时候的照片）
7.黑羽快斗（怪盗基德，先在TV76起了疑心，后在M3中通过假扮白鸟监视柯南发现）
8.本堂瑛佑（推理得知，设计逼迫柯南亲口承认）
9.诺亚方舟（泽田弘树）（《贝克街的亡灵》，通过“诺亚方舟”的DNA鉴定，完成“诺亚方舟”后将其作为自己的精神体释放，然后自杀）
10.宫野明美（柯南犹豫下后亲口承认，由于有10亿元的钥匙在手被杀害）
11.Irish (M13中先是在警视厅查了资料起疑心，后来通过指纹对比发现，没有报告组织，由于得到记忆卡，完成任务而被组织杀害）
注：关于知道他真实身份的角色中，泽田弘树和伊东末彦是有争议的。泽田弘树死后的思想存储在了计算机里，因此有人说是计算机的分析得出了柯南就是工藤新一的结论；有人认为伊东末彦知道他的真实身份，在此解释一下，泽田弘树做的是人工智能!
另注：在532话出场的庄堂胡桃在533话《呼唤过去的伤痕》中对柯南说的一句话,(即是：
庄堂胡桃：原以为是还没变声的矮个子高中生，没想到是这么小的孩子，就好像夏洛克福尔摩斯装成小孩子的样子呢！
柯南：是，是吗？
庄堂胡桃： 我看得见普通人看不见的东西哦。)证明她也有可能知道柯南的身份（不过她知道柯南身份的途径暂时未知）。
12.鲁邦三世（合作特别篇《鲁邦三世VS名侦探柯南》结尾部分）
13.次元大介（合作特别篇《鲁邦三世VS名侦探柯南》结尾部分）
14.石川五右介门（合作特别篇《鲁邦三世VS名侦探柯南》结尾部分）
15.峰不二子（合作特别篇《鲁邦三世VS名侦探柯南》结尾部分）
第4个回答 2010-05-15
1.阿笠博士：由柯南告知
2.灰原哀（宫野志保）（TV 129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件 两小时特别篇）：由搜索分析察觉，由阿笠博士告知。
3.服部平次（TV版本57~58福尔摩斯迷杀人事件）：在事件中察觉揭漏。
4.工藤优作（其父）：由阿笠博士转达。
5.工藤有希子（其母）：由阿笠博士转达。
6.贝尔摩德（即Vermouth/苦艾酒，与新一的母亲是朋友，见过新一小时候的照片）
7.怪盗基德（黑羽快斗）（剧场版世纪末的魔术师中化妆成白鸟警官偷听柯南的电话）
8.本堂瑛佑 （柯南亲口承认）
9.宫野明美（Miyano Akemi），即灰原哀（宫野志保）的姐姐 （亲口承认，TV128黑暗组织10亿元抢劫事件，已死）
10.Irish （真实身份未知，已死亡，见剧场版13 漆黑的追踪者，根据指纹对照证实）
11.泽田弘树（见剧场版06《贝克街的亡灵》，但有争议：泽田弘树死后的思想存储在了计算机里，因此有人说是计算机的分析得出了柯南就是工藤新一的结论）
12.鲁邦三世那一伙人
13.FBI等人可能知道
14.佐藤美和子可能知道（在《漆黑的追踪者》很怀疑的看着柯南）
第5个回答 2010-05-03
服部平次 灰原哀 工藤新一父母 阿笠博士 贝尔摩的
1.阿笠博士：由柯南告知
2.灰原哀（宫野志保）（TV 129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件 两小时特别篇）：由搜索分析察觉，有阿笠博士告知。
3.服部平次（TV版本57~58福尔摩斯迷杀人事件）：在事件中察觉揭漏。
4.工藤优作（其父）：由阿笠博士转达。
5.工藤有希子（其母）：由阿笠博士转达。
6.贝尔摩德（即Vermouth/苦艾酒，与新一的母亲是朋友，见过新一小时候的照片）
7.怪盗基德（黑羽快斗）（剧场版世纪末的魔术师中化妆成白鸟警官偷听柯南的电话）
8.本堂瑛佑 （柯南亲口承认）
9.宫野明美（Miyano Akemi），即灰原哀（宫野志保）的姐姐 （亲口承认，TV128黑暗组织10亿元抢劫事件，已死）
10.Irish （真实身份未知，已死亡，见剧场版13 漆黑的追踪者，根据指纹对照证实）
11.泽田弘树（见剧场版06《贝克街的亡灵》，但有争议：泽田弘树死后的思想存储在了计算机里，因此有人说是计算机的分析得出了柯南就是工藤新一的结论）
12.鲁邦三世那一伙人