在PCR反应中，emphasis：role=italicTaqemphasis酶通常会在延伸的PCR产物3′末端加上一个非配对的碱基A。根据这一特性研制出了一种线性质粒，其5′端各带一个不配对的碱基T。采用这样的质粒可将PCR产物以TA配对连接的方式直接进行克隆，即TA克隆。
用于TA克隆的载体被称为T-克隆载体，它的出现使PCR产物的克隆更加简便快捷。如pGEM-3Z4Z载体由pUC1819增加了一些功能片段改造而来，大小为2.74kb。与pUC1819相比，在多克隆位点的两端添加了噬菌体的转录启动子，如Sp6和T7噬菌体的启动子（link：xlinkhref=i010801图4-8link），便于克隆片段的测序。pGEM-3Z和pGEM-4Z的差别在于二者互换了两个启动子的位置。
脱氧胸腺嘧啶核苷（T）容易与其他碱基发生非特异性配对，而且T-克隆载体也容易同反应系统中残留的引物或不完整的PCR扩增片段连接。相比之下，UA配对具有更高的特异性。因此研制出一种5′端带一个不配对碱基U的线性质粒，即U-克隆载体。