事业单位聘用制和合同制肯定是聘用制好一些。因为和事业单位签订聘用制合同的一般是人员，也就是事业单位中的正式工，只有正式工才会通过与单位签订聘用制合同确定，也可以签订聘约，或者是颁发聘书，签订目标责任书等。服务年限也由合同约定。聘用制合同正式工是通过参加事业单位考试，考试通过被录用才会有事业编制。
而合同制是指事业单位中部分员工和是和事业单位签订的劳动合同，其实并不能算是正式工，只能算是临时工，合同的解释权归单位所有，一般是采用书面形式，通过签订合同招收短期的员工，合同中包括工作内容以及工作时限等。
相比较而言，聘用制的员工更加稳定，一般单位是不会也不能辞退的，同时待遇也会更好一些，虽然现在事业单位改革说明事业单位中要实行同工同酬制度，但是实际上，正式工的有很多福利是合同工享受不到的。
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