由于禽流感感染引起的流行特点、症状及病理变化与某些禽的传染病相似,必须及时做出鉴别诊断,如鸡新城疫、传染性支气管炎、传染性喉气管炎、传染性鼻炎、支原体病、衣原体病、产蛋下降综合征等;特别是某些疾病的混合感染或继发感染,使病情更为复杂,给诊断带来困难或容易发生误诊。因此,类症鉴别诊断十分重要。根据流行特点、症状、病理剖检和实验室检查(病原学、血清学)等综合分析,是可以区别开的。同样,继发或并发细菌病或病毒病时,通过病原分离和某些检测方法便可确定。
最近我国由H5N1亚型禽流感病毒引起的高致病性禽流感不是以前我国所出现过的鸡瘟。鸡瘟的学术名称叫新城疫,是1926年在英国一个叫新城的地方发现的一种疾病,故叫新城疫,其发病率和死亡率也非常高,曾给我国的养鸡业造成过巨大危害,但我国已有很好的疫苗控制新城疫,因此该病除了在农村有一些地方还有发生外,在规模化鸡场由于正确接种了疫苗,发病率和死亡率都很低,其危害程度比禽流感轻得多。高致病性禽流感无特定临床症状,表现为突然发病,在短时间内可见食欲废绝、体温骤升、精神高度沉郁,鸡冠与肉垂水肿、发绀,伴随着大批死亡,数天内死亡率可达90%以上。鸡新城疫与禽流感有明显的区别,其病原是完全两种不同的病毒。禽流感病毒是正黏病毒,新城疫病毒是副黏病毒。新城疫病毒感染在早期可见典型临床症状:潜伏期较长,有呼吸道症状,下痢,食欲减退,精神委顿,后期出现神经症状。在目前养殖条件下,新城疫疫苗免疫鸡群很少发生典型的新城疫,感染鸡群一般表现为轻微的呼吸道症状、神经症状和产蛋鸡群的产蛋下降,死亡率较低。